胃镜取样的良性和恶变组织的分子标志筛选

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胃癌是常见恶性肿瘤,其死亡率仍占世界第二位,仅次于肺癌。中国属胃癌高发国家,病死率较高。胃癌的5年生存率与其浸润深度有关,胃癌早期诊断和根治性治疗是取得良好预后的唯一途径。胃镜配合内镜活检病理用于早期胃癌的诊断后,由于胃镜活检以及病理学检查受限于取样医师的技术熟练程度和病理医生的判断等诸多主观因素,术前胃癌的漏诊率仍可达10%~20%。发展新的基于分子水平的胃癌早期辅助诊断系统对胃癌的防治至关重要。因此本课题通过比较胃镜下采集的病理诊断分别为胃粘膜良性和恶性病变组织的表达差异基因,寻找有效区分两者的分子标志组合。胃镜下取35对有病理诊断的病变胃粘膜和正常对照组织,提取总RNA,经RNA放大处理后和含有1299个基因的Oligo芯片进行杂交,局部加权回归法(LOWESS)进行数据归一化处理,SAM法鉴别组内差异基因,t检验法(P < 0.01)筛查恶性和良性组间的差异基因,Real-time PCR验证候选基因的在良、恶性表达差异。恶性病变粘膜组织分别与自身正常组织作对照进行比较,367个基因上调,261个基因下调;良性病变和分别与自身正常组织作对照比较,496个基因上调,252基因下调;组间具有极明显差异的基因共49个。49个基因组间差异基因的组合可100%成功区分胃粘膜良性和恶性病变组织。随机抽取49个基因中的6个基因,mRNA定量表达检测结果与芯片一致。应用49个基因组合对6例新的胃组织进行盲法检测,预测准确率达85%。因此,寡核苷酸基因芯片进行基因表达谱检测方法可以用于区分胃粘膜良、恶性病变的分子标志物识别研究。总之,通过上述研究我们初步确立了一个基因组合,可以从分子水平把胃粘膜的恶性病变和良性病变分别聚类,将为临床区别胃镜下胃粘膜病变是否为恶性提供有价值的参考。
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