补体C3d分子（complement component3d）是补体C3活化后的一个裂解片段，能够与受体CR2结合，是连接固有免疫与获得性免疫的一种重要免疫分子。目前对C3d的研究主要停留在分子佐剂阶段，将C3d三连体与抗原基因形成融合蛋白从而成千倍的提高机体特异性免疫应答反应，但对不同物种C3d分子变异、结构与功能关系鲜见报道。本研究通过克隆了16种不同禽类C3d基因，表达获得了鸡C3d重组蛋白并分析了C3d分子进化与结构、功能的关系，以丰富C3d的理论与应用研究。首先，克隆了16种不同禽类的C3d基因，登录Genbank并将之与哺乳动物C3d基因序列比较，进行生物信息学分析，构建基于C3d编码氨基酸序列的系统进化树，结果显示哺乳动物与禽类分别居进化树两端，相距较远，与传统物种关系差异吻合；在禽类区块内部分化为两个部分，但与禽类所属目、科无关。对C3d分子进化过程的选择情况进行分析，表明其整个基因处于纯化选择，但有8个可能发生阳性选择的氨基酸位点。以已发表的人C3d三级结构为模板，同源模建获得16种禽类C3d的三级结构，以鸡C3d结构为模板，标记阳性选择位点位置，显示其均处于暴露区，可能对于支持抗原结合域、提供CR2结合所需能量等有重要作用。其次，成功构建鸡C3d的bac-to-bac杆状病毒表达系统，获得pFB-C3d-BAC重组病毒，在sf9昆虫细胞内检测到高效表达的C3d蛋白；应用Anti-his单抗和Anti-C3d多抗进行Western-blot和免疫荧光检测，表明重组蛋白大小约为35kD，主要为细胞内表达，具有良好的免疫原性，为其免疫机制的研究奠定了基础。最后，采用基于寡核苷酸探针的基因芯片方法检测了16种禽类对于禽白血病病毒（ALV）B、E、J三种亚型的感染情况，结果表明7种禽类感染了E亚型，2种禽类感染了J亚型，无明显B亚型感染信号，结合系统进化和阳性选择分析，发现在进化树上相距较近的禽类染病且为同种亚型的概率较高，与临近未染病禽类进行氨基酸序列比较发现一些变异发生在阳性选择位点，并且可能是维持CR2受体结合及抗原区域结构稳定性的重要残基，从而推断C3d基因序列上的特定变异可能对机体感染疾病有一定的影响。