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动物父权关系的鉴定是行为生态学研究的主要内容。目前对无脊椎动物和脊椎动物中的鱼类、爬行类、鸟类和哺乳动物父权关系鉴定的研究相对比较充实。然而,对两栖动物尤其是对有尾类动物父权关系鉴定的研究较少,这很大程度上受限于多态性的微卫星分子标记的开发。两栖动物父权关系的鉴定对于后续深入研究其婚配制度和性选择的进化机制具有重要意义。因此,我们选择我国所特有的濒危有尾类动物中国小鲵(Hynobius chinensis)为研究对象,从中国小鲵转录组序列中筛选具有多态性的微卫星分子标记,并应用它们鉴定中国小鲵的父权关系。通过本文的研究结果,我们发现:1)运用在线的简单重复序列识别工具,我们从77111条中国小鲵转录组unigene序列中识别出4297条简单重复序列。按照引物设计标准,我们运用在线的Primer 3.0软件从74条unigene序列中设计出1 19对引物。经过引物优化和引物稳定性检测,最终筛选出13个具有多态性的微卫星位点。运用在线的GenePop 1.2软件对这13个具有多态性的微卫星位点在22个中国小鲵个体中的哈温平衡和连锁不平衡进行评估。我们发现13个具有多态性的微卫星位点显示哈温平衡,且没有微卫星位点显示连锁不平衡。Micro-Checker 2.2.3软件检测的结果显示13个具有多态性的微卫星位点中既不存在由于影子峰导致的评分错误,也不存在大片段等位基因的丢失。13个具有多态性的微卫星位点均可以用于鉴定中国小鲵的父权关系。2)中国小鲵父权关系的鉴定实验中,我们用到的实验样品包括118个中国小鲵成体脚趾样品(78个雄性脚趾样,40个雌性脚趾样)和2360个中国小鲵胚胎样品(39对卵袋)。运用Cervus 3.0程序,我们计算出这13个具有多态性的微卫星位点在2478个中国小鲵个体中的遗传多样性指数。每个位点的等位基因数在2-6个之间,每个位点的平均等位基因数为3.15个;每个位点的平均期望杂合度为0.402;每个位点的多态信息含量在0.019-0.550之间。运用Cervus 3.0程序,我们计算出这13个具有多态性的微卫星位点的累积非父排除率为92.6%。中国小鲵父权关系的鉴定结果显示39窝中国小鲵中有35窝中国小鲵均来源于2个或2个以上的遗传上的父本,多父权的比率为89.74%。3)我们初步探究了中国小鲵多父权的形成原因。对于雌性而言,同时与几个雄性个体交配能够提高子代的遗传多样性。我们推断遗传多样性假说可以解释中国小鲵多父权的形成原因。