20世纪80、90年代,为应对新技术革命的挑战,我国先后成立了53个国家级高新技术产业开发区。从设立之初,高新区的使命就在于创建有利于创新的局部优化环境,提升自主创新能力,使我国在未来的国际高科技领域竞争中占有一席之地。经过20年的发展,高新区一方面取得良好的经济增长实绩,另一方面却是园区利润率的逐渐下降,这种情况下,有学者提出了以提升研发能力为目的的“二次创业”问题。通过观察数据,发现高新区的研发创新能力存在明显的区域模式差异,本文即试图从经济学的角度解释这种差异。　　 本文立足于解释不同区域研发创新模式的差异,发现问题并提出有针对性的政策建议。论文在研究了高新区创新活动机理的基础上,构建了研发创新模式的区域差异理论模型,把研发创新模式划分为自主创新型、消化引进技术再创新型、完全模仿创新型等三种模型。本文进一步选取研发创新模式的直接指标和间接指标,运用统计指标对比分析法,呈现了七大区域研发创新模式的区域差异,并结合经济理论对这种差异进行解释,再对抽象出的这三种模式进行详细对比研究。　　 在计量实证部分,本文构建了研发的投入产出模型,并运用研发创新模式差异和管理模式差异进行经济解释。研究发现三种模式的高新区仍然存在不同问题:完全模仿创新型高新区陷入了低投入、低研发能力的恶性循环,消化吸收引进技术型高新区过于依赖外资,自主研发创新型高新区存在技术转化率低、研发行业和企业过于集中、基础研发薄弱等诸多问题。针对前两种模式,本文提出实现高新区研发创新模式转型的建议,针对自主创新型高新区,提出完善研发创新模式的建议。　　 本文的主要创新点在于:从区域层面进行创新模式比较研究。前人所作的研究或者在单个高新区层面研究某个高新区研发创新的实际情况,或者仅仅从理论方面研究创新模式,尚未有从区域层面分析并抽象出模式的研究,本文采用对比研究方法填补了这方面的空白。