谷氨酸棒杆菌L-天冬氨酸α-脱羧酶的结构与性质分析

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L-天冬氨酸α-脱羧酶(L-aspartate-α-decarboxylase, PanD)催化L-天冬氨酸生成β-丙氨酸,是泛酸生物合成途径中重要的调控酶。β-丙氨酸是自然界中唯一存在的β型氨基酸,它是一种非蛋白氨基酸,只存在于一些细菌、真菌和植物中,哺乳动物和人体中不存在,近年来,β-丙氨酸及其衍生物的研究日渐活跃,在环境、食品、化工、医药等领域的作用日渐突出。谷氨酸棒杆菌(Corynebacterium glutamicum)来源的PanD不依赖PanM蛋白,可以在体内快速完成自裂解过程,在酶法生产β-丙氨酸方面具有更好的应用前景。本文实现了C. glutamicum来源的PanD酶的高水平表达,系统研究了重组酶的酶学性质,并初步探讨了4个氨基酸残基位点对自裂解和催化活性的作用机制,为L-天冬氨酸α-脱羧酶的进一步理论研究和工业应用提供了支撑。主要研究结果包括:本文从C. glutamicum ST01菌株中克隆得到panD基因,将该基因连接到pET24a载体上(PanD酶C端融合His-Tag),并在Escherichia coli BL21(DE3)中成功表达出具有自身加工功能的PanD重组酶。利用His-Trap柱纯化,获得了纯度90%以上的目的蛋白。重组酶的比酶活可达2.60U/mg (156mmol/g·h)。酶学性质研究表明,其最适温度为55°C,最适pH为7.0。80°C下,PanD的半衰期约为40min。在37°C,pH7.5条件下,Km值为4.26mmol/L,Vmax为35.97nmol/min,kcat为1.02/s,催化效率kcat/Km为0.24/s·mM。将PanD蛋白的氨基酸序列进行同源建模,发现PanD与其他菌株来源的蛋白成员一样,包含9个β-折叠和2个α-螺旋,其中6个β折叠链位于结构的核心位置,形成双β折叠桶结构。结合模拟结构,对可能影响自裂解和活性中心的氨基酸残基Arg3、Lys9、Arg54、Tyr58进行定点突变。结果表明,只有将Arg3突变成带正电荷氨基酸才能够进行自裂解过程,突变体催化活性也无显著影响,既Arg3严格调控Gly24-Ser25之间酰胺键的断裂;Lys9、Arg54、Tyr58三个氨基酸位点的突变体尚可部分完成自裂解过程,而催化活性都显著降低,既这三个氨基酸位点对自裂解的影响微弱,但严格调控丙酮酰基的催化,这与它们在PanD蛋白结构中的重要作用相关。
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