在计划经济体制下,政府对高校进行直接管理,高校成为政府的所辖部门,高校没有办学自主权可言。随着中国的改革开放,计划经济向市场经济进行转变,原有的高等教育体制、高等教育管理方式已经阻碍了中国高等教育的发展。特别是随着经济社会的发展,人民群众接受多元高等教育需求日趋强烈,而僵化的高等教育管理体制和办学经费的短缺,公办高校的有限资源难以满足人们上学的需求。在此形势下,政府逐渐允许中国的民间资本投资办学,民办高校在艰难中开始起步。民办高校的兴起,为加快我国高等教育大众化的进程、满足经济的发展需求和调节教育资源的合理分配做出了巨大的贡献,并已经成为我国高等教育事业中一支不可忽视的生力军。近几年来,“钱学森之问”直指高等教育管理体制之弊端,建立现代大学制度,落实高校的办学自主权已成为我国高等教育管理体制改革的重要突破口之一。民办高校的办学体制与公办高校不同,办学自主权也有很大的不同。本文就大学章程对民办高校的办学自主权进行深入的研究。其中分别探讨民办高校大学章程的建设与实施,深入挖掘民办高校办学自主权和大学章程的内在必然联系,通过梳理民办高校自主办学的路径和大学章程的制订,深入剖析大学章程建设、实施中存在的问题,重点分析大学章程在民办高校自主办学过程中的困境及问题,集中研究大学章程实施不利的原因,并针对民办高校自主办学对大学章程建设及完善提出了六个方面的对策和建议：优化大学章程建设的法制环境；分化政府角色,转换政府职能；重视大学章程建设主体的多元化构建；明确董事会职责范围,规范投资方责权利；完善民办高校内部治理结构的意义和作用；注重传承历史,结合实际,突出高校个性。