随着全球经济一体化的飞速发展,创新正日益成为企业取得进步的源泉和动力。企业拥有丰厚的资本,而学研方拥有众多的创新人才,彼此之间进行协同创新合作可以实现巨大的经济效益和社会效益。但目前大多数协同创新项目的开展仍然存在很多的问题,在不同主体间无法进行合理的利益分配是导致最终项目无法成功完成的首要原因,而有效的测度是其进行合理分配的关键所在。目前这方面的研究还不够完善,缺乏各种利益量化标准的制定,尤其是在无形利益的量化研究方面还十分欠缺。因此在构建协同创新项目利益均衡机制的同时,研究出主要无形利益的量化方法具有一定的理论和现实意义。文章首先对协同创新项目的内涵以及主要利益相关者进行了分析,然后对协同创新项目的现状以及存在的一些问题进行了梳理,并对项目中经常会用到的相关理论进行了总结整理,接着在分析协同创新项目特点的基础上构建了目标规划求解模型来确定利益分配系数,并对模型中涉及到的一些变量进行解释,最后利用改良的Interbrand评估法对品牌的价值进行量化处理;在考虑技术价值、市场价值、权利价值的基础上构建了专利价值评估指标体系,并利用三角模糊分析法、模糊综合评价法等方法对其进行分析。通过对协同创新项目中主要无形利益进行量化处理,使得利益分配模型更加具有科学性和实用性,从而在保证协同创新项目总体利益最大化的基础上,各方利益均衡的目标也得以实现。本文得出的研究结果如下:1)协同创新项目利益分配的合理性对项目合作的成功起到无比重要的作用,只有满足不同主体的利益需求,也能保证合作项目总体利益最大化的目标得以实现。2)协同创新项目中既包括可以用货币来具体衡量的有形利益,又包括可以带来长期稳定的经济效益但缺乏有效衡量标准的无形利益,对无形利益的忽略往往会造成利益分配的失衡,导致最终项目的破产。全面的认识和界定协同创新项目中所涉及到的利益,才能更加合理地制定分配方案,才能保证协同创新项目不断向前发展。3)目标规划求解模型综合考虑了多主体的要求,符合多目标决策的思想,以此模型来对分配系数进行求解,有效地提高了利益分配合理性和各方合作的积极性,从而提升了项目合作的成功率。