近年来我国鼠害频发，对人类的生产和生活造成了极大的危害。黑线仓鼠（Cricetulus barabensis）作为北方平原的主要农田害鼠，不仅分布范围广、繁殖力强，对农业的危害程度大，而且传播疾病。因此，研究鼠类种群暴发机理、鼠类种群动态特征以及高繁殖机制，对制定合理高效的农业害鼠综合治理措施就显得尤为重要。肝受体同系物-1（liver receptor homolog-1，LRH-1）是一种在早期胚胎发育和成年个体中均有重要生理功能的转录因子，对胚胎和性腺发育过程、排卵过程都具有重要的调控作用。本研究以山东省沂南县和曲阜市黑线仓鼠为研究对象，根据GenBank数据库中大鼠（Rattus norvegicus）和小鼠（Mus musculus）的LRH-1基因设计引物，克隆出LRH-1基因启动子处475bp的DNA序列，1870bp（变体1）和1956bp（变体2）的mRNA序列，GenBank登录号分别为：JQ038149、JN367458和JN367459。黑线仓鼠LRH-1基因包含8个外显子和7个内含子，启动子上含有保守的GATA因子结合位点、E-box和典型的TATA盒。两种变体相差86bp的插入序列，分别编码541和501个氨基酸，其中亮氨酸（L）含量最高，达到10.9%与11.2%，色氨酸（W）含量最少，只有0.37%-0.4%，二级结构中含有大量的Alpha螺旋和Turn转角。变体2的蛋白缺失一个锌指结构，且受ER调控是乳腺癌细胞中LRH-1的重要形式。与其它19个物种的LRH-1mRNA序列进行比对，发现核苷酸水平（65.2%-88.6%）和氨基酸水平（63.7%-90.6%）均有较高的相似性，系统进化和聚类分析表明，LRH-1基因作为与动物繁殖、胆酸合成途径相关的候选基因在不同物种之间同源性较高，在进化上相对保守。对沂南和曲阜两个地理种群不同繁殖力黑线仓鼠LRH-1基因进行5’调控区SNP分析，发现18个SNPs，包括13个转换和5个颠换位点，共定义了16种单倍型，GenBank登录号为：JN585737-JN585752。经DnaSP5.0软件计算发现遗传多样性水平具有沂南种群>曲阜种群的特点，曲阜种群只发现一种单倍型，说明LRH-1基因在曲阜地区更保守。两个地理种群的基因流（Nm）、遗传分化系数（Fst）和种群间的核苷酸歧异度（Dxy）显示沂南和曲阜两个地理种群黑线仓鼠LRH-1基因具有一定遗传分化，但不显著；种群间基因分化系数（Gst）显示有80.8%的遗传变异存在于种群内部。对不同胎仔数相关性分析得出：胎仔数集中于3-5的序列发生变异较小，随着胎仔数的增加单倍型多样性、核苷酸多样性和基于分离位点数目的多样性逐渐增加；胎仔数与突变总数和转换数之间具有极显著正相关关系（P＜0.01）；突变与TATA盒上游序列和exon1具有显著正相关关系（P＜0.05），与TATA盒及exon1之间序列和颠换数无相关性，即随着胎仔数的增加，突变总数和转换数也增加，且突变多位于exon1和TATA盒上游。对发情期黑线仓鼠LRH-1基因的表达量进行测定，发现其在心、肝、脾、胃、肺、肾、肾上腺、卵巢、子宫、睾丸、附睾、脑12种器官中均有表达，以肝脏的表达量为最高，性腺的表达量雌性高于雄性，卵巢的表达量高于肾和肾上腺，且比子宫高2个数量级。雌雄性器官比较得出卵巢的表达量最高，其次为雄肾上腺、雌肾上腺、雄肾、雌肾、子宫、睾丸和附睾；随着胎仔数的增加卵巢内LRH-1的表达量逐渐减少，而子宫内的表达量先减少后增大；不同地理种群雄性黑线仓鼠中肾上腺的差异最明显，且表达量沂南＞曲阜。这一结果揭示LRH-1与排卵可能存在密切关系，这也与LRH-1调节卵巢发育、胚胎发育、卵巢性激素的合成等功能相吻合，此研究有助于揭示LRH-1与人类生殖及疾病的关系，为疾病的早期诊断和有效治疗提供新靶点。本实验中对黑线仓鼠LRH-1基因多态性的研究，对了解其多态性及表达量与胎仔数之间的关系具有重要意义，同时也为进一步研究黑线仓鼠LRH-1基因在各种复杂生理活动的调控中所发挥的生理功能奠定基础，从而从分子遗传学角度为鼠害的防治提供科学依据。