新世纪以来，认知科学发生了具大的变化，以具身认知为代表的第二代认知科学的产生，对学生的学习提出了新的要求。2008年，日本修订了《小学指导要领》，并于2011年发行了新的小学理科教材。我国目前仍实行2001年颁布的《科学课程标准(3-6年级)》，现行的教材均为2001-2003年审定。我国新一轮的小学科学课程标准修订工作正在进行。本研究采用文本分析法、文献分析法、比较研究法等，理论基础构建了“特异性思维”模型，提出了“神经元迁移长时记忆”假设，并把影响儿童《科学》学习的因素归结为：主客体关系维度、科学发展维度、知识传递维度三个维度。在此基础上对两国的现行课程标准与中日两国有代表性的四套教材进行比较，重点比较教材生物部分的内容结构，观察、实验、调查，此外对教材从记忆角度、元认知角度、创造力角度、科学精神角度、教材的系统性角度、生态化角度、生活化角度进行具体的分析，揭示两国教材的差异与特点，在此基础上提出几点启示，特别提出，适合中国的传统文化，开发中医药课程，推进我国生物课程的本土化。为我国小学科学新一轮科学课程标准及教材的修订提供参考。