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土壤微生物是土壤生物的重要组成部分,在土壤生态系统中有重要的作用。土壤微生物的组成和多样性对土壤的生态功能和土壤生态平衡起着非常重要的作用。同时,土壤的生物理化性质和地理环境对微生物的群落组成和分布有着决定性的作用。青藏高原是世界上海拔最高,面积最大的生态系统,本文以青藏高原最西部的阿里地区作为研究对象,采取13个样点,分为上下两层(上层：0-15cm;下层16-30cm),共26个样品,利用454焦磷酸测序技术研究阿里地区不同土壤深度细菌群落的分布和多样性,及其与环境因子的相关性。主要研究结果如下：1.青藏高原阿里地区土壤细菌有34大门类,放线菌(41.3%)、α-变形菌(9.3%)、酸杆菌(7%)、绿弯菌门(5.9%)、芽单胞菌门(7.2%)、β-变形菌(3.1%)、δ-变形菌(2.2%)、γ-变形菌(2.9%)、厚壁菌门(3.3%)、浮霉菌(2.1%)、拟杆菌(2%)等11大门类是优势菌门。其中上层土壤中δ-变形菌、酸杆菌和厚壁菌门的相对丰度显著高于下层,而p-变形菌和芽单胞菌门的相对丰度是下层显著高于上层。2.α-变形菌、δ-变形菌、酸杆菌和拟杆菌的相对丰度与土壤总碳(TN)呈负显著相关性；芽单胞菌门、浮霉菌的相对丰度与土壤总碳(TN)呈正显著相关性。α-变形菌的相对丰度和土壤氨态氮(NH4+)呈正显著相关性；芽单胞菌门和β-变形菌的相对丰度与土壤硝态氮(NO3-)和可溶性有机氮(DON)呈负显著相关性。α-变形菌的相对丰度和海拔(elevation)呈正显著相关性,而浮霉菌的相对丰度和海拔呈负显著相关性。3.青藏高原阿里地区上层土壤细菌的物种多样性(OTU)和系统发育多样性(PD)显著高于下层。分析发现,土壤硝态氮(NO3-)和土壤可溶性有机氮(DON)影响了土壤细菌物种多样性(OTU)和系统进化多样性(PD)在上下层土壤间的差异。4.青藏高原阿里地区土壤细菌群落分布分析发现,上下层土壤细菌群落分布完全不同。CCA和Mantel分析发现,土壤总碳(TC)对细菌群落的分布起主要作用。