【摘 要】
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本课题首先从形态学方面观察了Velcade处理后K562细胞的变化,然后进一步分析了K562细胞基因表达的改变。寻找差异基因的方法有很多种,如差异显示技术、代表性差异分析、抑制性
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本课题首先从形态学方面观察了Velcade处理后K562细胞的变化,然后进一步分析了K562细胞基因表达的改变。寻找差异基因的方法有很多种,如差异显示技术、代表性差异分析、抑制性消减杂交、基因芯片等。其中基因芯片是近年来发展起来的一门新的基因分析技术,尤其是表达谱基因芯片,可对基因表达情况进行全面、快速、敏感、高效的分析,因此本课题选用表达谱基因芯片作为研究工具。我们采用光镜、DNA片段化检测等方法,观测了Velcade处理后正常K562细胞的各种变化。提取两组细胞的基因组DNA,1.2%琼脂糖凝胶电泳检测。在光镜下观察Velcade处理后的K562细胞,发现细胞增殖被部分抑制,有的细胞体积变小、变形,细胞核浓缩,但细胞膜完整。DNA片段化检测结果显示Velcade处理组细胞DNA电泳条带呈典型的梯状条带,表明细胞出现凋亡。研究发现Velcade可以有效地抑制K562增殖,使细胞增殖进程受阻,并可导致部分K562细胞凋亡。
运用基因芯片技术,检测了Velcade处理后K562细胞的基因表达谱变化。首先提取对照组和Velcade处理组K562细胞的总RNA,采用Agilent BioAnalyzer2100进行RNA样品的质量鉴定。采用Agilent低RNA荧光线性扩增试剂盒对样品进行双色荧光标记:总RNA逆转录合成cRNA,以Cy3标记对照组K562细胞,Cy5标记Velcade处理组K562细胞,合成荧光标记的cRNA,并对标记的cRNA进行纯化。纯化后的样品和Agilent Human 1A60mer寡核苷酸基因芯片进行杂交,杂交完毕后依次用漂洗缓冲液进行芯片的漂洗。然后采用Agilent基因芯片扫描仪扫描,扫描后的数据采用Feature Extraction软件进行数据采集及标准化处理。然后采用Panther数据库对差异表达基因进行生物学功能分析。最后采用半定量RT-PCR对有进一步研究价值且表达改变显著的基因Nras、Etv6进行验证。在芯片22153个检测点中,发现共同差异表达基因640个,其中29个基因表达上调。KT-PCR结果表明与芯片杂交结果基本一致。Velcade处理后K562细胞基因表达谱的变化为:致癌基因表达下调。基因表达的总体变化趋势是促进凋亡、抑制增殖。
综上所述,本研究采用Velcade处理K562细胞,DNA片段化检测等手段,观测了K562细胞的变化。研究表明,Velcade可以抑制K562细胞增殖,并诱导部分K562细胞凋亡。研究进一步结合基因芯片技术,针对Velcade处理后K562细胞的基因表达谱进行研究,发现640个基因表达改变,其中29个基因表达上调,611个基因表达下调,表达谱的总体变化趋势是促进凋亡、抑制增殖。
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