火龙果作为新兴水果，有较高的营养价值，具有广阔的市场前景。目前国内火龙果种植品种较为单一，在品种选育方面研究较少，而肉色相关分子标记的研究目前尚未见报道。因此，探讨火龙果性状遗传规律和肉色相关分子标记对新品种的选育具有重要意义。本研究以“从化之星”火龙果实生后代群体为试材，主要进行了3个方面的研究：(1)采收结果单株的果实进行品质分析，通过对各项指标的统计分析和比较，从中选出了较优单株进行多点试验；(2)对得到的数据进行分布次数等分析，找出火龙果主要性状的遗传规律；(3)采用分离群体分组分析法(BSA，Bulked SegregantAnalysis)分别构建红肉和白肉火龙果DNA基因池，采用RAPD分子标记技术筛选出差异引物，再利用该引物对所有单株DNA进行PCR扩增验证，从而得到了能够稳定准确区分红白肉火龙果差异的RAPD引物。主要研究结果如下：　　1.分析了2010～2011年480个结果单株800个果实的主要品质指标，包括单果重、纵横径、TSS含量、还原糖含量、总糖含量、总酚含量、可滴定酸含量以及类胡萝卜素含量等。　　2.运用DPS统计分析软件进行Q-Q图检验等测验，得出各品质性状的分布规律，其中多数指标呈现标准的正态分布规律，少数指标为偏态分布，类胡萝卜素为对数正态分布。　　3.通过计算各项指标的均值、变异系数、极差等，分析各指标的变异度。结果发现：类胡萝卜素变异度最大，变异系数达到1.00；TSS含量变异度最小，变异系数仅为0.10；可食率及纵横径变异系数在0.12～0.16之间，糖酸含量及单果重等指标变异系数在0.29～0.42之间。　　4.综合分析各待选单株各项指标，找出各项指标排名均较高，或主要性状数值较高的单株，确定为初选优株。筛选出的5个较为优质的火龙果单株分别是红肉单株49-3和81-1、白肉单株93-2、外红内白单株94-3和97-3，上述5个单株的品质与目前的多数栽培品种比较均较优。　　5.在微量CTAB法的基础上，优化了火龙果嫩茎DNA提取方法，成功解决了火龙果组织细胞中粘质和多糖等问题。用该方法提取出的火龙果DNA质量高，可以用于分子标记等后续实验。　　6.采用单因素优化设计，建立了火龙果RAPD-PCR扩增体系，为进一步的研究工作提供了一个平台。　　7.利用建立的RAPD扩增体系，以30个红肉单株DNA及20个白肉单株DNA构建的基因池为模板，通过对1196条RAPD引物的筛选，最终得到了1条有差异的稳定的引物-AU10。然后运用该引物对上述50个单株DNA分别进行PCR扩增，发现该差异条带是红肉火龙果的特异条带，从而为鉴定红白肉火龙果提供了可靠的方法。