物种识别和种群数量调查是有效开展濒危物种保护与管理工作的基础。食肉目动物是分布较为广泛的一大类群，我国总共有8科37属57种，但种群数量较少。由于食肉目动物生性警觉且喜夜间活动，在野外很难直接观测到，因此对此类动物的调查保护工作一直都比较困难。目前应用于食肉目动物的物种识别方法主要有足迹识别法、毛发形态识别法以及分子生物学识别法等，其中足迹识别和毛发形态学识别存在不易观察、难辨别、低效等方面的问题，而分子生物学识别还没形成系统性的鉴定方法，因此目前食肉目动物的物种识别工作仍较为繁琐且低效。此外，传统的针对食肉目动物的种群数量调查方法（如足迹调查法、红外相机监测法等）存在准确性较低、估算结果粗略等方面的问题，因此迫切需要建立一种更为准确的物种识别和种群数量调查方法，以便更有效地开展食肉目动物的保护与管理工作。在本研究中，我们基于线粒体基因快速进化的特性，研究了细胞色素C氧化酶Ⅰ(COⅠ)基因序列在几种食肉目动物（猫科、犬科、獴科鼬科、熊科、熊猫科、浣熊科）中的种间差异，并基于COⅠ序列的种间差异成功建立了一种从不同食肉目动物组织样品中进行物种识别的方法。随后，我们应用这一方法对收集于动物园的食肉目动物（猫科、犬科）的新鲜粪便样品进行了分子生物学分析，获得了每个样品对应的COⅠ基因序列片段，然后与代表性物种的已知序列及NCBI数据库进行了比对，根据序列的差异性成功地对这些粪便样品进行了物种识别。在食肉目动物物种识别方法成功建立之后，我们将其应用于从珲春国家自然保护区采集的55份‘东北虎’粪便样品和1份毛发样品中，开展了物种识别、个体识别和性别鉴定等工作。结果，我们从56份样品中成功鉴定出7只东北虎和2只东北豹，其中雄性东北虎2只、雌性4只，1只性别鉴定未成功。在此基础上，我们对珲春国家自然保护区的东北虎种群进行了遗传多样性分析，并与已发表的东北虎研究结果进行比较，发现珲春地区的的东北虎种群遗传多样性相对较低。