高新技术产业无疑已成为全球经济的重要增长点，也是国家间经济竞争的重要力量。本文研究的对象——民营高科技企业在现实中已经成为我国经济发展的一个亮点，是否能促进当地民营高科技企业的迅速发展甚至成为很多地区经济发展的“节点”。 企业在很多方面历来都受到政府的干预，在中国这个有着“万能政府”传统的国家尤其如此，但是国家对微观经济个体——企业的过分干预也会严重阻碍企业的发展。企业和政府如何相机变化，特别是如何将政府管理这只“看得见的手”变为直指国民经济运行时弊，有效调节经济的“灵巧的手”，将“万能政府”转变为“有效政府”，使我国民营高科技企业在政府的帮助下尽快地成长起来，成为我国参与国际竞争的“领头羊”。研究政府与民营高科技企业的互动关系已经成为经济学、管理学、政治学、公共管理学界争相研究的问题。 本文首先跳出各门具体科学研究的局限，从自组织理论的角度来分析民营高科技企业和政府的互动关系，同时也希望通过对这种复杂的、非线性的互动关系的研究，得到在新的历史时期我国民营高科技企业管理的变化趋势，以及民营高科技企业如何更好地发展的规律。论文在最后讨论了民营高科技企业耗散结构的形成以及对我国政府管理部门的启示：(1)建立政府和民营高科技企业之间有效的信息交流平台；(2)政府转型，企业改制；(3)控制风险；(4)会聚人才。本文认为上述四点是新时期我国政府转变政府职能，促进民营高科技企业迅速发展的关键，同时也是新时期，民营高科技企业向政府行政提出的新要求。