海洋纤毛虫作为异养原生动物,是海洋微食物网(marine microbial food web)中的重要组成部分,在海洋初-次级能量流动和碳循环(pico-、nano-级向macro-级转移)过程中起着重要的枢纽作用。相关领域的研究(水体能量动力学与碳循环、近岸生产力评估、养殖生态学、环境保护等)目前所面临的突出和焦点问题在于:处于核心地位的纤毛虫原生动物,由于鉴定资料的严重缺乏和残缺而不得不被忽略。自二十世纪七十年代引入能够揭示其现代分类学特征(纤毛图式和银线系等)的银染方法以来,迄今关于海洋种类的现代研究资料极度匮乏,大部分已命名的“已知种类”等待确认,大量未明阶元有待鉴定和描述。鉴于以上原因,在国家自然科学基金重点项目的资助下,作者于2005-2008年间对青岛、烟台沿海及深圳红树林自然保护区等多类生境中的盾纤类、膜口类及腹毛类纤毛虫生物多样性开展了现代标准的分类学研究,共发现、鉴定纤毛虫38种隶属20属。其中新种12种,国内新纪录15种。主要成果包括:1.新属●阔口虫属Eurystoma nov. gen.,根据形态学的特征将该新属归入到盾纤目,阔口虫科,其定义为:口区硕大,三片小膜紧密排列于口器顶端;口侧膜几近围口一周,胞口位于口区前半部。2.十二新种在详尽的活体形态学与纤毛图式研究及与已知种的充分比较的基础上,建立十二个新种,丰富了海洋纤毛虫的生物多样性:盾纤类9种(相似裂纱虫,中华裂纱虫,查皮克帆口虫,维亚可夫帆口虫,中华帆口虫,维尔伯特帆口虫,格罗利帆口虫,中华阔口虫,异指状污栖虫),腹毛类2种(浅黄后尾柱虫,中华尾刺虫),低等动基片纲1种(细长尾毛虫)。3.十五种国内新纪录利用现代研究方法对以下十五种纤毛虫的中国种群进行了首次报道,补充了活体及纤毛图式信息:盐鬃毛虫,神圣柔页虫,加州环须虫,砂栖突口虫,纤细具刺虫,强健纤口虫,朦胧长吻虫,蠕状心口虫,坡捞膜袋虫,双小核草履虫,埃氏盘头虫,寡毛腹针虫,阿拉腹针虫,无色腹针虫,迪惕腹梭虫。4.对地位不明种类的廓清对国际间分类学资料不详且长期存疑的7个种的活体信息或纤毛图式做了首次报道,对前人遗留的混乱和错误进行了修订和澄清,给出了种的新定义并指定了新模:盐鬃毛虫,神圣柔页虫,加州环须虫,砂栖突口虫,纤细具刺虫,强健纤口虫和朦胧长吻虫。5.典型的沙隙类群的描述国内首次对典型的沙隙类群(纤细具刺虫,寡毛腹针虫,阿拉腹针虫,无色腹针虫和迪惕腹梭虫)做了完整的形态学描述并提供了其小核糖体亚基基因序列,为这一特殊类群的系统起源分析提供了证据。6.心口虫属的定义重修订鉴于心口虫属在定义上迄今缺乏完整的活体和纤毛图式水平的刻画,本工作在总结前人及本研究的基础上,给出了基于现代研究的新定义:心口虫属Cardiostomatella:虫体呈长柱状,体纤毛整齐;口器与四膜虫相似,口前缝合线明显;具口后动基列;尾纤毛一至数根,伸缩泡一至多枚。7.对12个已知种重描述基于青岛种群对以下种类的活体及纤毛图式做了补足性描述:蠕状心口虫,坡捞膜袋虫,冠帆口虫,双小核草履虫,特氏前口虫,缩原克鲁虫,维尔伯特泡毛虫,埃氏盘头虫,寡毛腹针虫,阿拉腹针虫,无色腹针虫,迪惕腹梭虫,恩茨伸颈虫。