本文主要研究内容是我国上市公司内部控制对审计意见的影响，并根据COSO内部控制框架和审计意见的基本理论分析以及实证研究的结果得出建立和完善我国上市公司内部控制体系的相关政策建议。本文采用规范研究和实证研究相结合的研究方法。以2011年在我国上海证券交易所上市的公司为研究样本，运用SPSS18.0统计软件对研究样本的内部控制和审计意见之间的关系进行实证分析。首先，在内部控制理论和审计意见影响因素国内外研究现状的基础上，阐述了内部控制和审计意见影响因素理论，对内部控制的基本概念和发展历程以及审计意见相关理论形成初步印象。其次，用内部控制相关经济学理论(委托代理理论、信号传递理论、信息不对称理论)来阐释内部控制产生和发展的理论依据，从而更深一层次的理解内部控制；同时，介绍了COSO内部控制框架和审计意见的相关理论。再次，对我国上市公司内部控制体系现状进行详细的分析并提出体系中存在的问题；再根据理论研究提出研究假设，构建多元线性回归模型，利用SPSS18.0统计软件对样本进行回归分析。最终得到五个显著相关的变量：董事长或副董事长是否兼任总经理、总经理是否在一个报告年度内变更、是否披露社会责任报告、上市公司规模和公司是否盈利。最后，根据研究结果提出建立和完善我国内部控制建设的相关政策建议：从控制环境角度，加强公司治理结构的建设和加强上市公司社会责任理念；从风险与评估角度，加强内部控制自我评价报告和公司业绩预告的编制和披露工作；从监督角度，完善公司自身内部控制的监督机制建设、加强政府部门的监督和提高会计师事务所内部控制审计业务能力。