FAM198A对结直肠癌的调控作用

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目的:本文的研究目的是探索结直肠癌新的发病机制,发现该疾病新的致病基因及其调控作用,为结直肠恶性肿瘤诊疗提供新的分子靶点。方法:首先,通过TCGA数据库搜索FAM198A基因在结直肠癌组织中的表达状态,以初步判断该基因是抑癌作用还是促癌作用。其次,运用慢病毒包装技术将FAM198A基因(实验组)和空病毒载体(对照组)稳定结合到SW480和HCT116细胞系中,并通过检测荧光表达率、蛋白印迹、RT-PCR实验验证FAM198A在两个细胞系中的过表达情况。下一步,为进一步探索FAM198A基因对结直肠癌细胞的调控作用,应用RNA-seq技术对比实验组与对照组的mRNA表达差异,并对表达水平发生显著变化的差异基因进行GO功能分类和KEGG通路富集的综合分析。最后,进行CCK8、平板克隆形成、Transwell、划痕愈合实验、基于NMR的细胞代谢组学检测等实验来验证FAM198A的基因功能。结果:(1)TCGA数据库显示:FAM198A在结直肠癌细胞中呈低表达状态。(2)RNA-seq的结果表明FAM198A的功能主要是调控肿瘤细胞行为和代谢过程。(3)根据CCK8和平板克隆实验结果,实验组与对照组之间细胞增殖率差异没有任何统计学上的意义,但是Transwell、划痕愈合实验结果显示FAM198A可以有效抑制HCT116和SW480细胞的恶性迁移、侵袭过程。(4)FAM198A基因主要影响结直肠癌细胞系的糖代谢、谷胱甘肽代谢及脯氨酸代谢过程,并且谷胱甘肽代谢通路的关键酶RRM2B和OPLAH在实验组中表达下调。结论:FAM198A在结直肠癌的发生发展中发挥抑制作用,其作用机制可能是影响肿瘤细胞的代谢过程。总之,FAM198A基因在将来有望成为结直肠癌诊疗的新靶点。
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