养殖池塘是一个相对封闭且较脆弱的生态系统，但同时也是一个易于调控的生态系统。池塘沉积物是养殖池塘生态系统的重要组成部分。首先，沉积物在养殖池塘中积累，一方面吸附水体中氮、磷等生物营养元素，形成营养元素的陷阱；另一方面沉积物藏污纳垢败坏养殖池塘的水质，恶化水体溶氧状况，增加养殖动物的发病机会。因此，研究养殖池塘沉积物的沉积规律、理化性质和微生物状况对控制其环境、充分利用沉积物的物质和能量具有重要的意义。1.于2010年7月-10月间，选择了浙江省宁波市横山码头三个南美白对虾覆膜养殖池塘进行水质、沉积物理化因子的研究，并采用PLFA法研究了沉积微生物在不同养殖阶段的的群落结构变化及与环境因子的相关性。结果表明：在整个对虾养殖期间，沉积物PLFAs组成以饱和脂肪酸、支链脂肪酸和单不饱和脂肪酸为主，多不饱和脂肪酸与环丙烷脂肪酸含量较少。微生物总生物量、细菌生物量和真菌生物量伴随着养殖的进行都明显增加。虽然沉积物微生物是以细菌为主体，但真菌更适应沉积物的环境，因此细菌/真菌的比值在不断降低。G+细菌/G-细菌的比值表现在养殖后期比中期有所下降，但在末期变化不明显。冗余分析（RDA）表明：微生物总生物量、细菌生物量和真菌生物量与TN正相关性最为显著，G+细菌生物量和G-细菌生物量与NO2--N、NO3--N呈现显著的正相关，这些微生物群落结构因子全部和SD呈现明显的负相关关系。2.于2010年8月-12月间，选择了浙江省宁波市咸祥养殖中心同一养殖区的两种不同增氧方式的养殖池塘，对其不同时期的水质和沉积物微生物群落结构变化进行了研究，结果显示：“底充式增氧”池塘水质优于“涡轮式”增氧池塘，养殖过程中池塘底部溶氧浓度维持在5mg/L以上，而采用涡轮式增氧的对照塘浓度维持在4mg/L；同时，底充式增氧池塘的三态氮浓度低于涡轮式增氧池塘。通过池塘沉积物微生物的PLFA谱图分析发现，底充氧池塘的微生物总量在整个调查周期内明显高于涡轮式池塘，且真菌/细菌、G+细菌/G-细菌的相对比值高于对照塘，通过特征脂肪酸18：1ω9c/18：1ω9t的比值来反映环境状况，结果表明：底充氧池塘环境状况优于涡轮式增氧池塘。3.于2011年4月到10月间，选择在浙江省宁波市沿海养殖区，选择了四口不同模式养殖池塘，包括淡水的大棚式对虾养殖池，海水的集约化对虾水泥养殖池，淡水的底充氧式对虾混合养殖池，以及海水的对虾泥蚶混养池，对其养殖末期的水质、沉积物理化因子，沉积物的微生物群落结构和酶活性进行了研究，结果显示：四种不同的养殖池塘的水质以淡水底充氧对虾养殖池塘最好，海水集约化养殖池塘最差；因海水集约化养殖池塘沉积物基质中有机质含量最好，因此微生物生物量、微生物活性，酶活性都是最高的，但是其真菌、G+菌的相对含量最低。主成分分析（PCA）表明：第一主成分主要与脲酶、有机质含量、微生物活性、total PLFA、B/F有较大正相关关系（r>0.9），与Gram+/Gram-、pH、18：1ω9C/T、单不饱和/支链有较大的负相关关系（r>0.9）；第二主成分主要与脱氢酶有较大正相关关系（r>0.8），四种池塘PCA图中分散开，说明其微生物群落结构及环境状况存在明显差异。