【摘 要】
：
目的:胃癌发生是一个多因素参与、多基因异常、多步骤发展的复杂过程,早期发现胃上皮细胞恶性转化表型特征和特异性分子事件,将有助于胃癌高风险个体识别、潜在治疗靶点筛选和预后评估。核不均一性核糖核蛋白（heterogeneous nuclear ribonucleoprotein,hnRNPs）是RNA结合蛋白大家族,在DNA修复、端粒生物发生、细胞信号转导、选择性剪接、m RNA稳定以及转录和翻译调节
论文部分内容阅读
目的:胃癌发生是一个多因素参与、多基因异常、多步骤发展的复杂过程,早期发现胃上皮细胞恶性转化表型特征和特异性分子事件,将有助于胃癌高风险个体识别、潜在治疗靶点筛选和预后评估。核不均一性核糖核蛋白（heterogeneous nuclear ribonucleoprotein,hnRNPs）是RNA结合蛋白大家族,在DNA修复、端粒生物发生、细胞信号转导、选择性剪接、m RNA稳定以及转录和翻译调节等方面发挥重要作用。hnRNPs异常表达是多种恶性肿瘤的特征之一,直接或间接参与肿瘤发生发展调控。前期工作中,我们利用TCGA-STAD和Oncomine数据库,联合分析了hnRNPs家族基因表达与胃癌风险的相关性,结果提示hnRNPU为胃癌组织差异表达基因。hnRNPU是一种双功能蛋白,参与pre-m RNA包装、选择性剪接调控和染色质组织重塑。本研究拟采用组织样本检测结合生物信息学分析方法,对hnRNPU表达与胃癌发生发展及预后相关性开展深入研究,并初步探讨其可能的作用机制。材料和方法:研究对象来自于2012-2019年中国医科大学附属第一医院就诊患者,收集40例接受外科手术治疗的胃癌患者新鲜癌灶组织和非癌对照组织,377例胃癌发生发展不同阶段石蜡包埋组织。采用实时定量PCR法（Real-time PCR）检测hnRNPU m RNA表达,免疫组织化学染色（IHC）检测hnRNPU蛋白表达。采用非参数秩和检验分析hnRNPU表达的组间差异及其与临床病理参数的相关性,绘制受试者工作曲线（ROC）用于诊断效能分析,单因素及多因素COX比例风险回归模型评估预后危险因素。利用公共数据库TCGA-STAD和Oncomine联合分析hnRNPU的胃癌表达特征。利用Bio GRID获取hnRNPU互作蛋白,进行KEGG通路富集分析。以hnRNPU表达中位值将TCGA中的胃癌样本分为高低表达两组进行GSEA分析。从TCGA Splice Seq数据库下载胃癌的可变剪接（AS）事件,筛选胃癌差异表达的AS（DEAS）。采用R语言cor.test函数计算DEAS的拼接百分比（PSI）与hnRNPU表达相关性。利用Cytoscape构建hnRNPU的可变剪接调控网络。结果:（一）胃癌风险、预后相关性分析:TCGA-STAD分析结果显示,胃癌组hnRNPU m RNA表达显著高于对照组（P<0.001）。胃细胞株检测结果显示,由GES-1→AGS→HGC27,hnRNPU m RNA表达水平逐渐显著增高（均P<0.05）。组织样本检测结果显示,胃癌组织hnRNPU m RNA和蛋白表达均显著高于非癌对照组织（均P<0.05）;由浅表性胃炎→萎缩性胃炎→异型增生→胃癌,hnRNPU蛋白表达渐次显著增高,hnRNPU蛋白诊断疾病胃和胃癌的AUC分别为0.911（95%CI0.877-0.945,P<0.001）和0.847（95%CI 0.809-0.886,P<0.001）;男性（P=0.008）、肿瘤大小<5cm（P=0.035）胃癌患者hnRNPU蛋白表达显著增高;女性（P<0.001）、年龄≥60岁（P=0.048）、HP阳性（P=0.002）、肿瘤多灶（P=0.009）、肿瘤大小≥5cm（P=0.001）、Lauren弥漫型（P=0.034）、弥漫浸润性生长（P=0.014）、T3-T4期（P=0.020）、淋巴结转移阳性（P=0.020）及TNMⅡ-Ⅳ期（P=0.028）胃癌患者,hnRNPU高表达者预后显著不良;COX回归分析结果表明,hnRNPU蛋白表达（P=0.016）和淋巴结转移（P=0.002）是影响胃癌预后的独立危险因素。（二）hnRNPU胃癌相关作用机制预测分析:Bio GRID筛选得到177个胃癌差异表达的hnRNPU互作蛋白,KEGG和GSEA联合分析结果显示,hnRNPU功能主要富集于剪接体通路。可变剪接数据分析发现了10504个胃癌DEAS,其中为hnRNPU差异互作蛋白、且与hnRNPU表达显著相关的AS事件属于ECT2和NKRF基因。结论:hnRNPU表达随胃疾病进展显著递进增高,具有诊断胃癌的良好效能,是影响胃癌患者预后的独立危险因素。hnRNPU可能通过调控ECT2和NKRF的可变剪接参与胃癌发生发展。
其他文献
目的:1.抗血管生成药物治疗卵巢癌的疗效与安全性的meta分析:通过meta分析,对抗血管生成药物在卵巢癌治疗中的作用进行系统评价,探讨抗血管生成药物治疗卵巢癌的有效性及安全性,为抗血管生成靶向治疗药物用于卵巢癌的临床合理应用提供依据。2.PARP抑制剂治疗卵巢癌疗效的meta分析:通过meta分析,对PARP抑制剂在卵巢癌治疗中的作用进行系统评价,探讨PARP抑制剂治疗卵巢癌的有效性,为PARP
政治监督是党和国家的根本性监督。推进政治监督具体化常态化，就是要牢牢把握政治监督具体化常态化的政治要求，紧紧围绕捍卫“两个确立”、做到“两个维护”开展政治监督。要从完善监督制度，严格执行规纪法，严肃党内政治生活，建设先进政治文化，发挥政治巡视的利剑作用，解决政治监督实践难题等方面着手，不断推进政治监督具体化常态化。
目的:全球癌症数据统计表明胃癌是当今世界最常见的肿瘤之一,发病率居世界第五位,死亡率居世界第四位。早期胃癌5年生存率接近90%以上,而晚期胃癌5年生存率往往只有20%-40%。由于胃癌起病隐匿,绝大多数患者一经确诊就已处于进展期。胃癌是一种高度异质性肿瘤,患者从化疗、放化疗、靶向治疗以及免疫治疗等方式当中获益非常有限。因此,进一步探索胃癌发生发展中的关键分子机制,了解胃癌的分子异质性,寻找在胃癌中
目的:研究体成分指标与结直肠癌（Colorectal Cancer,CRC）发生及患者营养状况的关系,为今后制定结直肠癌的防治措施及结直肠癌营养状况评估提供理论依据。方法:本研究采用病例对照研究设计,选取2018年6月至2019年1月在中国医科大学附属第一医院肿瘤外科、胃肠外科和肛肠外科住院的194例CRC患者作为病例组。选择相同时期内按年龄、性别、城乡和病例组匹配的康复保健科、体检中心的286例
目的:胃癌是一种具有高度异质性的恶性肿瘤,预计每年有超过一百万的新病例。胃癌是世界发病率第五的恶性肿瘤。胃癌由于早期发现率低,患者诊断时通常已经处于晚期,因此胃癌患者的预后差、死亡率高。找到适合的胃癌治疗靶点已成为了目前延长胃癌患者生存期的关键问题。MASK家族蛋白主要包括MASK1（ANKHD1）和MASK2（ANKRD17）,它们是一类分子量较大的蛋白质,它们主要的结构域包括锚蛋白重复序列和一
前言:结直肠癌是全球第三大癌症,死亡率位列全球第二。辅助化疗是提高结直肠癌病人术后生存率及生存质量的重要手段。然而,Ⅱ期结直肠癌的辅助化疗疗效尚存在争议。虽然早有多项相关研究,但大多数并未发现辅助化疗可以给Ⅱ期结直肠癌病人带来生存获益。综合相关研究,多部治疗指南均建议为高危Ⅱ期结直肠癌病人提供辅助化疗。但高危因素的定义只参考了整体预后情况,并未单独考虑辅助化疗带来的生存获益,现阶段仍无证据证明Ⅱ期
目的:胃癌是世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁着人类的生命安全。本研究的目的是通过构建竞争性内源性RNA（ceRNA）调控网络,探索新的胃癌预后标志物。此外,免疫细胞已成为多种肿瘤发生和发展中的关键调节因子。我们利用免疫基因构建胃癌的预后模型,从而更好的预测胃癌患者的预后。方法:我们从癌症基因组图谱（TCGA）数据库中下载了RNA表达数据。通过比较胃癌样本与正常组织样本筛选出差异表达的长链非
目的:胃癌是对人类健康的主要危害,研究表明,90%的早期胃癌患者可以通过切除来治愈。然而,现有的肿瘤标志物,如癌胚抗原、糖类抗原19-9等在胃癌诊断中的阳性率较低。因此,探索更加有效的胃癌诊断和治疗的分子靶标将具有重要意义。环状RNA（circular RNAs,circ RNAs）是近年来发现的在真核细胞中广泛存在的非编码RNA,可作为分子“海绵”吸附miRNA和转录调节因子。近年来,circ
目的:饮食因素与任何类型的癌症都密切相关,尤其是它与结直肠癌的联系极其紧密。但是由于饮食的数量、模式、烹饪方法的变化,对这些饮食成分对结直肠癌风险的影响有不同的结论。本研究旨在通过文献计量分析,病例对照研究及荟萃分析对饮食相关因素与结直肠癌发病风险之间的关系做一综合探讨。研究方法:从Web of science检索饮食与结直肠癌风险研究方面的出版物。使用VOS Viewer 1.6.14软件进行文
目的:CXCL17及其可能受体,GPR35,被报告与肿瘤的发生发展相关,但其在胃癌（Gastric cancer,GC）多阶段发展中的作用尚不清楚。我们的研究旨在评估CXCL17-GPR35在GC多阶段发展中的表达及其相关功能。方法:通过免疫组织化学的方法检测胃疾病链“非萎缩性胃炎（NAG）-肠上皮化生（IM）-GC”中CXCL17和GPR35的表达（445名病例进行了CXCL17检测,317名病