与苦苣菜黄网病毒(SYNV)P蛋白互作的寄主蛋白对SYNV侵染影响的研究

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苦苣菜黄网病毒(SYNV)是一种单股负链RNA病毒,它侵染菊科植物,是重要的作物病毒病原之一。SYNV的核衣壳蛋白P是一种磷蛋白,是聚合酶复合体的重要成分之一。SYNVP蛋白能与N蛋白互作来调控病毒复制和转录之间的转换,它与细胞核输入和细胞核内病毒发生基质有关。此外,P蛋白也是一个有效的病毒沉默抑制子。研究P蛋白功能对于揭示SYNV病毒致病机理及抗寄主的防御机制等具有重要意义。本研究利用酵母双杂交技术筛选与SYNVP蛋白互作的寄主本氏烟蛋白,通过构建烟草脆裂病毒(Tobacco rattle virus,TRV)沉默载体浸润接种本氏烟沉默相关基因,来观察基因沉默对SYNV侵染的影响,从而筛选出与SYNV侵染有关的寄主基因。研究成果将为了解在 SYNV侵染过程中病毒与寄主的互作机制,进而为制定SYNV防控策略奠定基础。  本研究以SYNV的P蛋白作为诱饵,利用酵母双杂交技术筛选本氏烟的cDNA文库,通过QDO和QDO/X培养基双重筛选,获得125候选的阳性克隆。经过点滴稀释培养及自结合实验验证,排除假阳性后共获得107个阳性质粒。利用基因测序及序列分析,最终获得48个已知序列,它们编码的蛋白质能在酵母中与SYNVP蛋白互作,其中有16个序列所表达的蛋白质与遗传信息储存和处理相关,17个与细胞过程和信号转导有关,12个与物质合成代谢及能量转换相关,还有3个功能未知。构建了41个TRV沉默载体,分别用于沉默与P互作的41个寄主蛋白的基因,通过浸润接种法将重组TRV载体侵染本氏烟后进行表型观察,发现8个沉默载体接种后能引起本氏烟表型的显著变化,4个虽会引起表型改变但不影响后续实验,另外还有29个表型变化不明显,通过RT-PCR检测证明了TRV载体都已成功侵染本氏烟。最终选择33个基因用于后续研究,即接种 TRV沉默载体10d后,再摩擦接种SYNV来观察基因沉默对SYNV侵染的影响。通过小批量接种后症状观察及方差分析,初步确定18个基因的沉默可能会对SYNV的侵染造成影响。Western blot分析表明病毒积累量的差异与对应植株症状表型差异相符合。扩大 SYNV接种株数,利用发病时间的趋势及方差分析,最终确定有2个(22#和38#)基因的沉默会推迟SYNV发病时间,检测结果说明这2个基因的沉默效率较好,都大于70%。另外,还对5#、11#、13#、22#4个进行基因沉默并接种SYNV的微型复制子系统,发现11#、13#和22#3个基因的沉默会影响P蛋白的转录功能。
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