中国典型生态环境下钙皮菌科系统发育研究

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黏菌(myxogastrea)是原生动物界中的特殊类群,生活史中有部分阶段为原生动物特征,部分阶段表现出真菌的特征。黏菌大部分喜潮湿阴凉,广泛分布于世界各地。常见的生长基质类型为腐木、枯枝、落叶等。钙皮菌科Didymiaceae隶属于绒泡菌目Physarales,绒泡菌目是黏菌纲中最大的一个目,包含41%的黏菌物种。目前世界已报道钙皮菌科黏菌7属208种,而我国记载钙皮菌科黏菌6属81种,仅占世界报道的38.94%。钙皮菌科有大量种我国还未曾报道,还需继续进行大量资源采集工作。本研究结合形态学鉴定与分子生物学技术,对钙皮菌科黏菌进行了较为系统的研究。2016年7月至2018年12月在西藏林芝地区、黑龙江省、吉林省、辽宁省共采集黏菌标本1546份,其中钙皮菌科黏菌标本385份。形态学鉴定获得钙皮菌科黏菌5属36种,其中3个为中国钙皮菌属新记录种隐微钙皮菌Didymium inconspicuum Nann.-Bremek.&D.W.、离壳钙皮菌Didymium karstensii Nann.-Bremek.和大疣孢钙皮菌Didymium rugulosporum Kowalski。吉林省新记录种3种:灰色双皮菌Diderma cinereum Morgan、小晶钙皮菌Didymium eximium Peck和扁平钙皮菌D.applanatum Nann.-Bremek.;辽宁省新记录种2种:球形双皮菌D.globosum Pers.和畸形钙皮菌D.difforme(Pers.)Gray;黑龙江省新记录种6种:辐射双皮菌D.radiatum(L.)Morgan、白环钙皮菌D.anellus Morgan、直线钙皮菌D.orthonemata H.W.Keller&T.E.Brooks、卵形钙皮菌D.ovoideum Nann.-Bremek.、纹孢钙皮菌D.trachysporum G.Lister和疣孢钙皮菌D.verrucosporum A.L.Welden;甘肃省新记录种5种:辐射双皮菌D.radiatum、白环钙皮菌D.anellus、扁凹钙皮菌D.bahiense Gottsb.、网纹钙皮菌D.intermedium J.Schr?t.和卵形钙皮菌D.ovoideum;云南省新记录种3种:扁凹钙皮菌D.bahiense、小晶钙皮菌D.eximium和小钙皮菌D.minus(Lister)Morgan。对鉴定的钙皮菌科黏菌进行描述,并提供研究标本号、生境以及国内外的分布等信息。结合大量的文献资料,编写了各省以及不同气候带类型分布的钙皮菌科黏菌的名录,汇总分析了我国钙皮菌科黏菌的分布情况,清楚的列出国家新记录种。通过数据分析得知吉林省和亚热带分布的钙皮菌科黏菌种数最多。本论文共获得钙皮菌科黏菌4属17种SSU rRNA序列36条,运用贝叶斯法对钙皮菌科黏菌进行了系统发育分析。系统发育分析结果表明:球形双皮菌Diderma globosum位于其他钙皮菌科黏菌的前端并单独处于一个分支,推测双皮菌属Diderma是最早分化出来的,钙皮菌属Didymium是相对高级的类群。球囊白柄菌Diachea bulbillosa(Berk.&Broome)Lister与软骨钙皮菌Didymiun leoninum Berk.&Broome处于同一分支上,所处位置与形态学分类结果相符。白环钙皮菌Didymium anellus和隐微钙皮菌D.inconspicuum处于同一小分支上,其共同的形态学特征为无柄孢囊,囊轴无或不显著;小晶钙皮菌D.eximium、黄柄钙皮菌D.iridis(Ditmar)Fr.、疣孢钙皮菌D.verrucosporum和鳞钙皮菌D.squamolosum(Alb.&Schwein.)Fr.&Palmquist处于同一分支上,其共同的形态学特征为有柄孢囊,囊轴显著。在这一分支上,根据柄以及囊轴的有无将其清楚的分开。黑柄钙皮菌D.nigripes(Link)Fr.在遗传距离上产生了两个小分支,从物种分布的位置可以看出:采自西藏的标本聚集在一起,采自黑龙江省和吉林省的标本聚集在一起,在较高的bootstrap支持下,形成姊妹群,由此推测地理隔离影响了遗传距离。同时,黑柄钙皮菌D.nigripes在不同生长基质上在遗传距离上并没有明显的相关性。
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