草原生态系统是我国最主要的陆地生态系统,在气候调节、物质循环和能量流动方面存在着不可替代的作用。土壤微生物对全球气候变化的响应将直接决定我国草原生态系统对气候变化反馈的程度。内蒙古短花针茅荒漠草原地处干旱半干旱区域,对气温和降水等环境的变化响应敏感,研究内蒙古荒漠草原对降水变化的响应,有助于确定未来降水变化下荒漠草原生态系统的适应方式。本研究利用野外控制性模拟降水试验和微生物高通量测序技术相结合的手段,以短花针茅荒漠草原土壤微生物为主要研究对象,研究不同降水梯度处理对土壤理化性质、土壤细菌和土壤真菌的微生物群落结构及多样性的影响。试验采用完全随机区组设计,设有4个不同降水处理梯度,分别为减少50%自然降水、自然降水、增加50%自然降水和增加100%自然降水,每个处理3次重复,共计12个试验小区。在每个模拟降水处理下,采用五点取样法用内径7 cm的土钻采集0～10 cm土壤,带回实验室测定土壤理化性质及微生物。主要结果如下:（1）模拟降水处理改变了土壤细菌优势群落结构的丰富度以及土壤细菌的多样性指数。细菌放线菌门的相对丰度随着降水处理梯度的增加先减少后增加,酸杆菌门的相对丰度随着降水梯度的增加先增加后减少,厚壁菌门的相对丰度随着降水增加表现出先增加后减少再增加的趋势,细菌群落多样性指数随着降水增加先增加后下降（P<0.05）。放线菌门的放线菌纲、酸杆菌门酸杆菌纲和厚壁菌门下的杆菌纲是揭示荒漠草原降水变化下引起土壤细菌群落结构变化的细菌类群。（2）模拟降水处理改变了土壤真菌优势群落的丰富度以及土壤真菌多样性,真菌担子菌门的相对丰度随着降水的增加而增加,被孢霉门的相对丰度随着降水的增加先减少后增加,真菌的群落多样性指数均随着降水梯度的增加而增加（P<0.05）。担子菌门下的双生担子菌属、毛孢子菌属以及球囊菌门下的球囊菌纲是揭示荒漠草原降水变化下引起土壤真菌群落结构变化的真菌类群。（3）模拟降水处理下,降水与土壤细菌群落结构和细菌多样性之间存在显著负相关关系,与土壤真菌群落结构和真菌多样性之间存在显著正相关关系（P<0.05）。在土壤理化性质中,对土壤细菌群落结构及多样性造成的主要影响因子是土壤全磷含量;对土壤真菌多样性造成影响的主要影响因子是土壤pH值。