研究背景星状病毒是导致人发生急性腹泻病的重要病原体之一,由Appleton和Higgins于1975年首先在胃肠炎患儿的粪便中发现。据已有研究,鼠类也可以携带星状病毒。我国香港学者Chu等于2007-2008年间曾在香港地区的褐家鼠粪便中检出过一种新型星状病毒(褐家鼠星状病毒)。通过系统发生分析发现,该病毒与同在香港发现的一株新型人星状病毒进化关系较近,提示两种病毒可能具有有共同祖先。鉴于鼠类与人类接触密切,为了了解鼠类及与之生活环境相近的臭鼩睛在星状病毒传播过程中的可能作用,我们采集了广州市与厦门市两地的鼠类及臭鼩鼱的粪便样品进行星状病毒核酸检测、分析病毒的基因型别并探讨星状病毒跨种属传播的可能。研究方法1.星状病毒携带情况调查1.1.样本采集于2014年10月至2016年2月间,在广州市及厦门市多地以笼捕法每月捕捉鼠类及臭鼩鼱。捕获的动物麻醉后采集直肠端粪便提取粪便总RNA待检。1.2.病毒核酸筛检使用半巢式PCR方案,对样品进行星状病毒RdRp基因片段检测,按动物种类统计阳性率。1.3.病毒核酸验证使用香港检出的褐家鼠星状病毒序列为参考序列设计PCR方案,对筛检阳性样品病毒特异性片段扩增。2.星状病毒序列测定及基因分析2.1.样品选择及测序从阳性样品中选择质量较好的重新进行总RNA提取。提取完成后将核酸样品送大连宝生物公司,根据选定的病毒序列模板进行全序列测定。2.2.序列分析以测序时使用的模板序列作为参考序列进行病毒株变异情况分析。并从NCBINucleotide数据库中下载有代表性的序列进行多序列比对、系统进化及空间结构分析。结果1.样本采集捕捉到5种鼠类及1种臭鼩鼱共713只动物。其中鼠类共427只(317只为褐家鼠,64只黄毛鼠,44只黄胸鼠,及板齿鼠、白腹鼠各1只),臭鼩鼱286只。2.星状病毒检测从713份标本中检出共204例星状病毒阳性。其中黄胸鼠检出率最高(71.88%),褐家鼠次之(43.53%),黄胸鼠再次(22.73%),臭鼩鼱最低(3.5%)。204份阳性标本中,有93份标本病毒核酸验证实验成功,能够扩增出褐家鼠星状病毒的特异性片段。3.全序测定及基因分析获得较完整星状病毒序列2株。1株与香港学者发现的褐家鼠星状病毒高度相似;而另外1株推测为新的病毒亚型。氨基酸及空间结构的比对结果显示,褐家鼠星状病毒与人星状病毒MLB1型ORF2区一致性不高。结论1.广州及厦门部分地区的鼠类普遍携带有褐家鼠星状病毒。2.臭鼩鼱可以携带褐家鼠星状病毒,但星状病毒是否会感染臭鼩鼱还有待进一步研究。3.褐家鼠星状病毒的多样性还有待被进一步揭示。4.褐家鼠星状病毒与人星状病毒MLB1进化关系较近,可能具有共同的祖先。但褐家鼠星状病毒目前可能不存在跨种属感染人的能力。