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目的：回顾分析中等度、高度复发风险原发性胃肠道间质瘤的诊治经验，探讨胃肠道恶性间质瘤的合理治疗方案和预后影响因素。方法：回顾分析广西医科大学第一附属医院胃肠腺体外科2008年1月～2012年12月收治的所有原发性胃肠道间质瘤病例的临床、影像学检查、手术资料及术后病理资料，对所有R0切除术患者按改良NIH复发风险评估标准行良恶性潜能分级，统计中等度、高度复发风险原发性胃肠道间质瘤病例的诊治经过、手术治疗情况、术后靶向药物甲磺酸伊马替尼（imatinib mesylate，商品名：格列卫）辅助治疗情况、随访患者术后肿瘤复发转移时间、复发转移后再次治疗情况以及患者的总生存时间。统计分析该组病例的术后1、3、5年的无复发生存时间（recurrence-free survival,RFS）和总生存期（overall survival, OS）。结果：总计收集中等度、高度复发风险胃肠道间质瘤原发性病例50例，男性29例，女性21例，年龄23～79岁，中位年龄53岁，原发肿瘤部位包括胃33例（胃窦6例，胃体11例，胃底16例），小肠17例（空肠10例，回肠7例），肿瘤直径2～25cm，平均直径8.21cm，术后病理检查：细胞有丝分裂数2～75个/50HPF，中位数8个/50HPF，免疫组化检查：CD117阳性率88.9%(40/45)，CD34阳性率90.9%(40/44)，Dog-1阳性率81.6%(31/38)。该组病人术后1、3、5年的RFS分别为92%（46/50），64%（32/50）和44%（22/50），术后1、3、5年的OS分别为98%（49/50）,86%（43/50）和60%（30/50），原发肿瘤部位，肿瘤大小，有丝分裂数，术后是否接受甲磺酸伊马替尼（imatinib mesylate，商品名：格列卫）辅助治疗都是患者预后的影响因素。结论：1.原发性胃肠道间质瘤完全切除术后有复发和转移风险。2.中等度及高度恶性胃肠道间质瘤术后应给予甲磺酸伊马替尼辅助治疗，辅助治疗剂量400mg/d，持续治疗1年是安全的，能延长患者的RFS。3.对术后复发或转移病例，如行再次手术治疗，往往是姑息性减瘤手术，对延长患者OS无显著作用，且再次手术难度及风险大，因此，对复发胃肠道间质瘤病例，最佳治疗方案应是行甲磺酸伊马替尼治疗，以控制病情进展。4.组建胃肠道间质瘤多学科治疗团队，参照国内外专业机构公布的胃肠道间质瘤治疗指南确定GIST个体化治疗方案，努力提高患者接受甲磺酸伊马替尼靶向治疗的依从性，进一步提高有服药指证病人的服药治疗比率，对提高胃肠道间质瘤疗效具有重要意义。