上海东方肝胆外科医院作为全国知名的三甲专科医院,长期以来积累了大量的有价值的医学信息。但是,现阶段医院系统仍使用人工录入和文件方式存储数据,且基础业务数据分散,数据质量不高。随着医院数据量的快速增长,将无法满足实时快速的数据分析要求。且对于一般医疗科研人员而言,较难从中获得有用的信息。因此医院迫切需要建立一个独立的肝癌主题数据仓库,能够统一地、有效地管理海量医疗数据,并从中抽取出最有价值的数据,按照科研人员的需求进行分析,以提供决策支持。首先讨论了医院内肝癌领域医疗数据分析的现状和存在问题,明确建立肝癌数据仓库的必要性。其次,在对肝癌的监测、早预和治疗的统计分析需求进行分析的基础上,确定建立以原发性肝癌患病与预后情况分析为主题的数据仓库。在此基础上,详细讨论了肝癌数据仓库的模型设计,粒度层次划分；然后介绍了东方肝胆医院如可利用Microsoft SQL Server2008Integration Services(SSIS)实现肝癌数据仓库的ETL设计过程。其中详细介绍了数据清洗的流程和框架,来保证ETL过程中数据质量的控制以及脏数据处理。最后、还讨论了肝胆医院肝癌数据仓库的特点与不足之处。