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目的:采用差异凝胶双向电泳技术(Two-dimensional difference gel electrophoresis,2-D DIGE)和同位素相对标记与绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)分析大鼠上橄榄复合体(superior olivary complex, SOC)差异蛋白,。方法:从P60健康的雄性Sprague Dawley (SD)大鼠的脑组织中,分离出耳蜗核、SOC和下丘,其中剩余大脑组织作为对照。用2-D DIGE和iTRAQ技术分别检测出SOC细胞质和细胞膜差异表达蛋白质,并经生物信息学分析这些差异表达的蛋白质功能。结果:2-D DIGE图像比对分析,发现26个SOC胞质蛋白点,质谱分析检测到17种SOC胞质蛋白质。iTRAQ技术共鉴定1937个脑干胞膜蛋白质,比较分析确定SOC中有14种差异表达的胞膜蛋白。SOC胞质和胞膜差异蛋白生物信息学分析提示,Alanine--tRNA ligase、glutamyl prolyl Trna synthetase、 Alpha-internexin和Choline transporter-like protein 1、Tubulin alpha-4A chain主要参与神经系统发育、神经传递和突触可塑性,其余蛋白大多与能量代谢相关。结论:SOC中,Alanine--tRNA ligase、glutamyl prolyl Trna synthetase、 Alpha-internexin、Choline transporter-like protein 1和Tubulin alpha-4A chain等蛋白可能与中枢听觉信息处理有关,为后续进一步研究中枢听觉处理障碍的发病机制提供了理论依据。