本文应用联合异速生长尺度模型对4939尾牙鲆的多个形态性状对体质量或体长的异速生长进行了遗传分析。结果表明:形态性状相对体质量的异速生长的遗传力从0.251到0.755不等;而相对体长的异速生长中,除了尾柄高的遗传力很高为0.871外,大多数形态性状表现为中等遗传力。此外,这些异速生长尺度的遗传相关大多数是负的。本研究利用DMU软件包,对2617尾360日龄牙鲆的体质量和体长、头长、尾柄长、体高和尾柄高进行了单变量和多变量分析,并应用朱军提出的统计分析方法进行了条件遗传效应分析。应用数量性状的遗传模型估计了数量性状的遗传方差组分、遗传相关和遗传力等遗传参数。结果表明:单变量分析中的大部分性状都表现为高等遗传力(0.424~0.582),只有尾柄长表现为中等遗传力,为0.373。多变量分析中的性状都表现为高等遗传力,范围在0.403~0.640之间,遗传相关也都在0.7以上。这证明各个性状的都具有很好的遗传性能,性状特征很大程度上都能够稳定地遗传给它们的后代,对这些性状进行选择育种应该可以取得良好的成效。朱军法构造的条件性状与单个性状的育种值相关在0.008~0.364之间变动,说明条件性状与单独的性状之间的影响不明显。通过回归法比由多性状分析的协方差矩阵构造的条件育种值与单性状育种值之间的相关更接近于零,说明回归法构造的条件性状与单性状是完全独立的,针对这些性状进行选择育种应该能达到很好的成效。本论文还运用转录组测序技术研究了红鳍东方鲀的鳃和鳔之间的SNP差异情况,发现相同位点但类型不同的SNP有1183个,而SNP位于基因的exon区域并在转录表达水平存在显著差异的基因,有11个在鳔中的表达量明显多于鳃,30个在鳃中的表达量明显多于鳔。前者主要是起保护支持以及稳定身体的作用,还有一些跟能量代谢相关的基因。而鳃中比鳔表达量多的基因主要在机体免疫方面发挥作用,还有部分基因参与了呼吸、信号传递等过程。