GWAS筛选的基因多态性与幽门螺旋杆菌在胃癌易感性中的交互作用研究

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背景和目的:近期发表的三项全基因组关联研究(GWAS)报道了新发现的中国人群中胃癌易感性的基因多态性,其中三个单核苷酸多态性(SNP)(分别为rs4072037, rs13361707和rs2274223)是位于与宿主炎症反应相关的基因上。而幽门螺旋杆菌(HP)也是通过引起宿主炎症反应引发胃癌的重要因素。因此,本研究将探索这三个SNP位点与幽门螺旋杆菌感染对胃癌的发生是否存在基因-环境的交互作用,从而进一步揭示胃癌发生的高危因素。方法:共有来自于同济医院335例胃腺癌病人和334例正常对照人入组。用Taqman探针法对GWAS中三个SNP位点(分别为rs4072037, rs13361707,rs2274223)进行基因型检测。用酶联免疫吸附剂测定(ELISA)方法检测幽门螺旋杆菌的血清学反应。应用SPSS17.0软件用多因素logistic回归方法分析每个变量与胃癌发病风险之间的关系以及基因-环境交互作用分析,计算优势比(odds ratio,OR)值及95%可信区间(95%confidence interval,95%CI)等.结果:多因素Logistic回归分析调整性别、年龄、体重指数(BMI)、吸烟、饮酒和HP感染因素后,应用显性模型分析GWAS中三个SNP位点的变异性基因型与胃癌发病风险结果:rs4072037(AG+GG)发生胃癌的风险为OR=0.50,95%CI为0.35-0.72;rs13361707(CT+CC)发生胃癌的风险为OR=1.63,95%CI为1.14-2.33;rs2274223(AG+GG)发生胃癌的风险为OR=1.33,95%CI为0.96-1.83。多因素Logistic回归分析调整性别、年龄、体重指数、吸烟和饮酒因素后,幽门螺旋杆菌感染也显著性增加了胃癌易感性(OR=1.74,95%CI为1.27-2.38)。进一步探讨基因与HP感染的交互作用,相较于HP血清学阴性且携带非危险基因型的人群,HP血清学阳性且携带危险基因型的人群发生胃癌的危险性最高。调整性别、年龄、BMI、吸烟和饮酒因素后,相较于HP阴性且rs4072037AG/GG基因型人群,HP阳性且rs4072037AA基因型人群发生胃癌的OR为3.96,95%CI,2.30-6.81;相对于HP阴性且rs13361707TT基因型人群,HP阳性且rs13361707CT/CC基因型人群发生胃癌的OR为2.65,95%CI,1.60-4.37;相对于HP阴性且rs2274223AA基因型人群,HP阳性且rs2274223AG/GG基因型人群发生胃癌的OR为2.45,95%CI,1.55-3.87。并且,用基因-环境相乘交互作用模型计算后,这三个SNP位点与幽门螺旋杆菌的血清学阳性对胃癌的发病风险均存在显著性的交互作用(PG×E均<0.05)。结论:我们的研究表明GWAS发现的三个新的SNP位点可能与幽门螺旋杆菌感染存在交互作用,从而增加胃癌的发病风险。这三个SNP位点可能在幽门螺旋杆菌相关性胃癌发病机制中起着重要作用。
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