对于我国目前水资源开发利用中出现的一系列问题，许多专家纷纷提出建立水权制度，以公有制水权为基础，通过效率优先、兼顾公平的水权初始配置，实行可交易水权，使水资源达到优化配置。论文针对水权理论和制度的建立对水权初始配置、水权转让和水管理组织结构带来的影响进行初步的探讨，具体内容有如下几个方面： 1．综述我国水资源概况，分析我国水资源开发利用中面临的严峻形势，指出解决水资源危机的办法。 2．论述水权理论的基础以及我国水权理论研究的进展。 3．应用层次分析法对水权初始配置进行简要分析，并应用基于对策论的交互式多目标规划解法进行分析。 4．研究水权交易的种类并提出回购协议和抵押贷款的交易方式，然后介绍垄断市场和水权市场，以及垄断市场的几种定价方式，最后建立水权转让的两部制价格模型。 5．分析各种权变因素——组织战略目标、环境因素、技术和规模等对水管理组织的影响，探讨目前水管理组织结构存在的不足，并根据组织设计的原则，对基于水权理论的水管理组织结构进行再设计。