巴氏杜氏藻ζ-胡萝卜素脱氢酶基因启动子序列的克隆及其活性验证

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杜氏藻是一种无细胞壁的单细胞真核绿藻,其抗逆性极强,能够在在0.05mol/L~5mol/L的盐水中生长,是今所发现的最耐盐的真核生物,并被作为研究植物和藻类耐盐机理的重要模式生物。巴氏杜氏藻(Dunaliella bardawil)作为杜氏藻的一个常见藻种,其能够在极端条件,如高盐,高光照强度,高温等条件下大量累积β-胡萝卜素,其主要以两种形式存在,即9-顺式和全反式两种异构体,用以保护细胞免受光抑制作用的伤害。在不同的诱导条件下,巴氏藻细胞内的β-胡萝卜素含量可达到细胞干重的14%。从遗传学角度分析,巴氏藻对β-胡萝卜素的富集主要是受到类胡萝卜素代谢途径中各种酶的调节。酶的代谢又受到基因的调控,这些酶基因的启动子中存在着各种作用元件,这些作用元件受到不同环境因素的影响,从而调节目的基因的合成量,进而影响最终整个代谢调控。ζ-胡萝卜素脱氢酶(ZDS)基因是胡萝卜素生物合成途径中的一个关键酶之一。本实验中,根据实验室已获得的D. bardawil藻ZDS基因的cDNA序列,设计引物,通过PCR的方法,获得ZDS基因的编码区序列。然后根据获得编码区序列,利用基因组步移的方法获得其两端侧翼序列:启动子和终止子。实验室已经得到ZDS基因的cDNA序列全长2209bp,其中开放阅读框长度为1749bp。本实验获得的完整ZDS基因全长11,896bp,其中编码区序列(从”ATG”到”TAA”)长度为6435,编码区上游序列4091bp(包括33bp的5’UTR序列),编码区下游序列1370bp (包括411bp的3’UTR序列)。将编码序列与cDNA的开放阅读框进行比对,发现整个编码区序列含有12个外显子和11个内含子,其中内含子长度达4686bp,约为外显子(ORF)长度的2.68倍,内含子均以GT开始,AG收尾,属于最常见的内含子类型。根据生物信息学分析的转录起始位点信息,以ZDS基因编码区序列上游2899bp序列为启动子,下游1217bp序列为终止子,以增强型绿色荧光基因(EGFP)为报告基因,构建基因表达盒pZDS-EGFP-tZDS。利用电转化法,将含有表达盒的重组质粒导入巴氏杜氏藻中,并成功表达EGFP蛋白,从而验证了ZDS基因的启动子和终止子具有活性。
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