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洋葱伯克氏菌群(Burkholderia cepacia complex,Bcc)的细菌主要存在于水体、医院和农业环境中,虽然部分Bcc被认为是有益菌,但不少是世界公认的植物和人体致病菌。了解水体、医院和一些植物上的Bcc菌的种类及其遗传多样性,对我国Bcc菌的利用与环境安全极其重要。然而,国内外尚无这类详细的研究报道。本研究以西湖水为主要研究对象,对水中的Bcc种类及其动态作了较深入研究；并从医院环境中获得的细菌中筛选出Bcc菌,调查了我国一些医院环境中主要存在的Bcc种；同时对由Bcc菌引起的杏果新病害——杏果腐病作了研究。对西湖水、医院及杏果中所获得的Bcc菌的种类、致病性及其致病基因进行了比较研究,同时针对Bcc菌抗药性强和防治难的特点,本研究还对防治Bcc菌的新物质进行了探索。取得了如下的主要研究结果：(1)采用培养和非培养的分子检测方法,在为期一年的时间内定点定时对西湖水中的Bcc菌种类及其遗传多态性作了研究；同时与来自医院和杏果Bcc菌进行了分析和比较。通过选择性培养基PCAT共获得776株疑似Bcc菌株,对这些菌疑似Bcc菌株作了recA基因的PCR特异性扩增,共确定309株Bcc菌,其中265株、42株、2株分别来源于西湖水、医院和杏果。采用限制性内切酶HaeⅢ对这309株Bcc菌的recA基因片段进行了限制性酶切(RFLP)分析。结果表明,在西湖水的265株Bcc菌中,发现7种不同的限制性酶切图谱(F,G,I, H, J, B, A);在医院来源的42株Bcc菌中,发现了3种不同的限制性酶切图谱(K,G,H)；杏果腐Bcc菌的限制性酶切图谱为H,这是国内外首次发现Bcc菌可引起杏果病害。这表明在这些环境中,Bcc菌群存在明显的遗传多态性。(2)采用recA-HaeⅢ限制性酶切分析、基因型特异性引物扩增、recA基因的序列分析和多位点序列分型(MLST)技术,对309株来源于西湖水、医院和杏的Bcc菌进行了种群分析。首次明确了在西湖水中存在B. multivorans, B. cenocepacia, B. stabilis, B. vietnamiensis和B. seminalis5个Bcc种,其中以B.cenocepacia的菌株数量最多,占分离自西湖水的Bcc总量的51%。在医院环境中存在B. cepacia, B. cenocepacia和Burkholderia contaminans3个种,其中也以B. cenocepacia的菌株数量最多,占分离自医院环境的Bcc总量的73.8%。而引起杏果腐的病原细菌鉴定为Bcc中的B. seminalis,这是B. seminalis首次作为植物病原菌被发现。MLST技术研究表明,该技术不仅可以区分Bcc的种,还可以区分种内菌株间的差异。(3)对分离自西湖水、医院和果腐杏的93株Bcc代表菌株进行了致病性及其毒力基因BCESM的检测和菌株蛋白酶活性研究。在测试的93个菌株中,只有17株对洋葱不致病,其余76株均能引起洋葱鳞茎不同程度的腐烂,说明这些菌株是洋葱的致病菌；在测试的7个Bcc种中,B. multivorans和B. vietnamiensis菌株没有产蛋白酶活性,其余种的大部分菌株均有产蛋白酶活性,说明西湖水中和果腐杏上的Bcc菌同样具有与对人体致病相关的毒力因子,与医院致病菌没有差异。在苜蓿模型上,来源于医院的B. cepacia,B. cenocepacia和B. contaminans菌株均能导致苜蓿幼苗发病,来源于西湖水的B. cenocepacia也能导致苜蓿幼苗发病,与医院临床致病菌表现出相似的症状,这表明来源于西湖水的这些Bcc菌株也是人体的潜在致病菌。在所有Bcc菌中,从A8和Y5上检测到毒力基因BCESM,确定了这两个菌株的高风险性。(4)分别检测了来自医院、西湖水和杏果的29株Bcc代表菌对4种抗生素(头孢西定、四环素、硫磺多年菌素、万古霉素)和壳聚糖的敏感性,结果发现Bcc菌对这4种抗生素都存在抗性,而壳聚糖被认为能有效抑制Bcc菌的生长,这一新发现为防治Bcc菌在医院的污染及其对CF病人的感染提供了新思路。