蛋白质结构预测与腺苷酸激酶构象多型性的研究

来源 :中国科学院生物物理研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ck198
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该论文主要包括以下三个部分:1.蛋白质结构预测 蛋白质结构预测技术现已成为蛋白质结构研究的重要方法.我们利用改进的多重线性回归方法并结合进化信息和一致性预测方法,提高了蛋白质结构预测的准确率.在2002年进行的CASP5中对57条目标蛋白的二级结构预测准确率为77.5%.比该组在CASP4中的准确率(69%)有很大的提高.对CASP5的目标蛋白的三级结构预防方法,主要是基于二级结构预测结果基础上的同源建模方法,其预测方法还有待改进.2.腺苷酸激酶构象多型性的研究 ANS与底物竞争结合荧光动力学与AP<,5>A抑制性质表明,在不存在底物的时候,AK就预先存在着具有不同底物结合性质的多种天然构象.由ANS探针区分的AK的天然构象由两种构象亚系构成.两种亚系都具有催化活性,并含有一系列能与不同底物结合的预先存在的构象.N<,1>亚系能与ANS直接结合,而N<,2>亚系不能与ANS直接结合,且对底物的结合有更高的特异性.3.大分子群集及蛋白质二硫键异构酶对牛胰核糖核酸酶重折叠的影响 蛋白质二硫键异构酶(PDI)能大大提高牛胰核糖核酸酶(RNase A)在体外无氧化还原剂对条件下的复性速度及产率.当复性体系中存在PDI及不同的Crowding试剂时,牛胰核糖核酸酶的复性过程受到的影响明显不同.复性后延迟5小时,在含有或不含mPDI的复性体系复性中加入PDI,RNase A在不同Crowding试剂的条件下的复性表现出不同的现象,特别是BSA为Crowding试剂时基本不复性,说明RNase A可能与BSA发生了特异性的相互作用.PDI在大分子群集条件下对RNase A复性的作用机制还需要进一步阐明.
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