本论文以甘肃省最南端以保护多目标物种为保护对象的白水江国家级自然保护区为实例,针对保护区内的大熊猫、金丝猴和羚牛种群,进行GIS区域分析。结合现有数据,通过ArcGIS对各类数据源处理分析,以食物、水和隐蔽物,以及人类干扰,坡度、海拔、公路等影响因子为主,基于生态适宜性指标的分析,获得白水江自然保护区的植被资源、地形地貌、人类干扰等情况。由此获得了以下主要研究结果:　　 1.建立自然保护区是对濒危物种进行抢救性保护的最有效措施。保护区的建立可以使区内的自然资源、景观资源得到有效的保护,为区内野生动物提供良好的生存环境,保障种群数量的健康发展,是周边地区的生态屏障,是物种资源及生态系统的天然贮存库。　　 2.大熊猫适宜栖息在保护区核心区内的面积为23851hm2,金丝猴适宜栖息地在保护区核心区内的面积为10895hm2,羚牛适宜栖息地在保护区的核心区面积为8446hm2,且目标物种生态位在保护区内有重叠。　　 3.白水江自然保护区的功能区设置合理,核心区能够对保护区内大熊猫、金丝猴、羚牛65％以上的野外栖息地起到有效保护。同时生境破碎化、人类活动的干扰等问题明显,需要保护管理者加强保护管理力度,对周边社区加强环保教育,提升公众环境保护、野生动植物保护意识,实现保护区与社区和谐发展。　　 4.在GIS下对保护区内目标物种栖息地的评估,可以方便快捷、可视化的为决策者提供保护策略,对保护区建设、发展提供可靠的科学依据。但室内数据分析离不开常规野外监测数据的支撑,数据来源、监测样线的设置、数据质量将决定最终结果的精度。