在自然界中,很多植物含有较高水平的次生化合物,以抵御植食性动物的取食。单宁(Tannin)是植物体中的多酚类次生化合物,可与蛋白质结合形成单宁-蛋白质复合物,从而影响动物体对食物的消化和蛋白质的有效吸收。与此同时,动物又会通过不同的方式去分解利用这些次生化合物。一些鼠类肠道微生物中含有单宁降解菌可以分解单宁,使得高单宁食物中的蛋白质得以被这些鼠类吸收,提高食物利用率。花鼠(Tamias sibiricus)和大林姬鼠(Apodemus peninsulae)虽然都喜食含高单宁的蒙古栎(Quercus mongolica)橡子,但二者对高单宁食物适应的肠道微生物基础尚不清楚。鉴于此,本文以花鼠和大林姬鼠这两种鼠类为研究对象,采用16S rDNA技术手段分析花鼠和大林姬鼠肠道微生物结构与组成的多样性和差异性,并基于生理代谢差异来阐释两种鼠类适应高单宁食物的肠道微生物基础。主要研究结果如下:(1)在自然状态下,花鼠和大林姬鼠肠道菌群的OUT值有显著差异。二者肠道菌群在种和科的分类水平上有显著性差异,而在界、门、纲、目和属的分类水平上无显著差异。花鼠和大林姬鼠肠道菌群的Chao1指数有显著性差异,Observed指数、Shannon指数和Simpson指数则无显著性差异。花鼠和大林姬鼠的肠道菌群无论是组成成分还是菌落结构都有着很大差异。(2)花鼠和大林姬鼠在长期喂食蒙古栎后,二者肠道菌群的OUT值有显著差异。花鼠的肠道菌群群落结构无显著改变,但组成成分有显著变化。大林姬鼠肠道菌群的群落结构和组成成分无显著影响。大林姬鼠对高单宁食物的耐受性与适应性大于花鼠。(3)象甲幼虫(Curculio arakawai)肠道微生物中主要有乳球菌属(Lactococcus)、沙雷菌属(Serratia)和假单胞菌属(Pseudomonas)对单宁具有降解活性。花鼠和大林姬鼠取食3高温灭菌和未灭菌的象甲幼虫后,花鼠灭菌组、未灭菌组的体重显著高于对照组,未灭菌组取食橡子量显著高于对照组,灭菌组和未灭菌组的排便量显著大于对照组。然而,是否取食象甲幼虫对大林姬鼠的体重、取食橡子量以及排便量都无显著影响。花鼠未灭菌组的粪便含氮量显著低于灭菌组和对照组,喂食象甲幼虫后对大林姬鼠粪便氮含量影响达到近乎显著水平。花鼠和大林姬鼠未灭菌组的干物质消化率都显著大于对照组。花鼠和大林姬鼠的对照组肠道菌群与象甲幼虫的肠道菌群共有136个相同的OTUs,花鼠和大林姬鼠的未灭菌组的肠道菌群与象甲幼虫的肠道菌群共有143个相同的OTUs。大林姬鼠的对照组、未灭菌组和灭菌组在饲养30天后都的肠道菌群都以厚壁菌门(Firmicutes)占主导优势。在属的分类水平上,是否吃象甲幼虫并不会对大林姬鼠肠道菌群产生影响,而花鼠部分菌属有显著改变。花鼠和大林姬鼠三组实验鼠的肠道菌群群落的相对丰度差异显著。花鼠灭菌组肠道菌群的组成成分与对照组无显著差异,但灭菌组与未灭菌组的肠道菌群组成成分有显著差异。花鼠对照组肠道微生物群落结构与未灭菌组和灭菌组无显著差异。大林姬鼠对照组、未灭菌组和灭菌组三组之间无论是菌群组成成分还是群落结构都无显著差异。(4)移植大林姬鼠粪菌的小鼠(M.musculus)和饮取新霉素的小鼠体重在实验末期有上升趋势,而移植花鼠粪菌以及灌胃生理盐水的小鼠体重则持续下降。移植大林姬鼠粪菌的小鼠与移植花鼠粪菌的小鼠之间肠道菌群群落结构有显著差异,而饮取新霉素的小鼠与灌胃生理盐水的小鼠之间群落结构相似。粪菌移植科显著改变这四组小鼠的肠道菌群组成。