犬11个STR基因座荧光复合扩增体系的构建

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微卫星DNA,又称短串联重复序列(STR),是一类具有高度多态性的DNA分子标记,被广泛应用于遗传学、法医学等领域的研究,如基因物理图谱的绘制,动、植物遗传育种的指导及亲权鉴定。本文第一、二部分通过筛选11个高度多态的微卫星基因座PEZ1、PEZ2、PEZ3、PEZ5、PEZ6、PEZ8、PEZ12、FH2010、FH2054、FH2132和FH2611,自行设计引物,应用聚合酶链式反应(PCR)、毛细管电泳和荧光检测等方法,构建11个STR基因座的荧光复合扩增体系。本文第三部分是通过扩增120头警犬的DNA样本对构建的荧光复合扩增体系进行检验,并对该11个STR基因座在法医学上的应用进行了统计和分析。结果表明构建的11个STR基因座荧光复合扩增体系扩增效率好,扩增结果均一,同色各基因座间无重叠,且没有非特异性扩增。法医学分析表明该11个STR基因座在两种犬上的平均杂合度(Ho)为0.502,平均多态信息含量(PIC)为0.64,累积非父排除率为0.9330621,累积个体识别率(DP)为0.999999。Hardy-Weinberg平衡检验表明PEZ3和FH2010在德国牧羊犬中偏离Hardy-Weinberg平衡。本研究成功构建的犬11个STR基因座荧光复合扩增体系为实现犬STR荧光检测试剂盒的国产化迈出了坚实的一步。该复扩体系可以帮助解决在进行犬DNA检测采取传统方法时的诸多问题,如耗材多、成本高、费时和工作量大,尤其在处理大量样本时。而相比之下,由11个基因座组成的荧光复合扩增体系具有耗样量少、信息量多、高效且成本低的优点。
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