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目的 应用全基因组表达芯片研究山西吕梁地区神经管畸形(neural tube defects,NTDs)胚胎脑组织中状念特异性表达基因;将差异表达基因从四氢叶酸代谢水平、基因表达调控蛋白、信号转导途径、凋亡等途径分类;进一步研究于神经系统发育相关的血小板源性生长因子受体α(platelet-derived growth factor receptor-alpha PDGFRα)及其调节因子PAX1、PAX3-FKHR、EGFR在神经管畸形疾病中的作用机制。 方法 利用全基因组表达芯片高通量筛选出NTDs各发病阶段的异常表达基因;并从生化与分子生物学的角度加以归类,揭示出NTDs的异常基因表达谱;从中选择出PDGFRα基因应用半定量RT-PCR技术扩增PDGFRα及其调节因子PAX1、PAX3-FKHR、EGFR并验证其改变,同时应用免疫组化分析PDGFRα在蛋白质水平的表达。 结果 芯片结果显示出异常表达的基因22209个,其中2倍表达增高的基因74个,包括氧化磷酸化途径中相关基因3个,锌指结构基因7个,与抗氧化谷光甘肽通路基因2个,与花生四烯酸合成代谢相关的基因2个,MMPs相关的基因4个,G蛋白膜受体家族相关基因6个等。2倍表达降低的387个,其中与核酸代谢通路相关基因8个,炎症反应相关基因7个,参与凋亡途径的基因6个,整合素家族信号系统相关基因2个,三羧酸循环通路相关基因4个,G蛋白膜受体家族相关基因9个等,PDGFRα呈20.9倍增高;半定量RT-PCR结果显示NTDs胚胎中PDGFRα表达高于对照组(p<0.01)结果显示NTDs胚胎中其调节因子PAX1、PAX3-FKHR、EGFR表达高于对照组(p<0.01),免疫组化结果显示NTDs组PDGFRα蛋白表达高于对照组(p<0.05)。 结论 基因芯片研究结果显示NTDs脑组织与对照脑组织的基因表达谱相比存在很大差别,证明NTDs的发生和发展是一个复杂的多阶段的过程,是多种相关基因表达失常所致,涉及核酸代谢、信号转导、基因表达调控、凋亡等基因的异常改变;PDGFRα调节细胞的生长、存活,并且对细胞的形态和细胞运动如细胞的分散、趋化、聚集、凋亡等有作用。PDGFRα的过度表达干扰了神经上皮细胞正常的分化、迁移和凋亡,导致膜信号转导系统紊乱,凋亡信号减弱,神经上皮某些细胞持续生长不分化(神经胶质、软骨前细胞等),继而影响正