随着对褐藻寡糖、低聚果糖和果糖研究的不断深入，人们逐步认识和接受了它们的生理活性，故生产褐藻寡糖、低聚果糖和果糖的手段成为目前研究的热点，而酶法以其反应温和、易控制、安全、副产物少等优点被各方报道，所以筛选能够生产该酶的菌株无疑成为研究的焦点。本研究就是为了得到能够高效利用褐藻胶和菊粉的菌株。从海洋环境中分离筛选出高产褐藻胶裂解酶的菌株H3，从土壤中筛选得到高产菊粉外切酶的菌株JY30。研究中选择褐藻酸钠作为培养基的唯一碳源。从海带的病烂处分离得到一株高产褐藻胶裂解酶的菌株H3，经形态学初步观察后确定其为细菌。故可以选用16SrDNA技术手段对其进行种属鉴定，得出其同盐单胞菌的16S核糖体DNA序列相似性在90%以上。以自制新鲜菊粉作为唯一碳源从多年生菊芋的根际土壤中筛选得到一株高产菊粉酶菌株JY30。高效液相色谱（HPLC）法对菌株降解产物进行分析，结果显示菌株JY30底物反应后的产物主要为果糖，进一步得出所产菊粉酶主要显示外切酶活性。为了确定菌株的最优发酵条件，通过单因子实验确定最优碳源为菊粉，最佳浓度为60g/L；最优氮源为酵母浸粉，最佳浓度为70g/L；pH值为7。然后通过Central Composite Design中心交叉试验设计对三个显著因素进行响应面优化，同时建立并分析了各影响因子与菌株底物还原糖含量的数学模型。试验结果显示，回归方程P=0.0001﹤0.01，决定系数R2为97.66%，以上试验数据说明所建模型与试验值达到理想的拟合度。菌株产酶活力的优化发酵条件为菊粉9.37%，酵母浸粉7.3%，pH值7。在此工艺参数下，酶解底物还原糖浓度达0.25mg/mL。与未优化前相比，菌种的底物还原糖浓度从0.026mg/mL增加到0.25mg/mL，提高了9.5倍。