农产品加工业作为重要的国计民生行业,其高质量转型升级的成功与否,是促进农民增收,实现农业农村经济高质量发展,并最终为乡村振兴提供新动能的关键所在。而传统观点一般将行业产品由低质量向高质量转变作为其高质量转型升级的重要标志,其中可贸易部门的产品质量更是一个国家产业发展水平和竞争力的重要体现;同时,从出口质量升级的驱动因素来看,当前的现实背景客观需要中国农产品加工业出口质量的提升是由创新行为所主导的。因此,构建创新驱动型的农产品加工业出口质量升级模式,是保证中国农产品加工业实现高质量转型升级的核心任务。另一方面,增值税是对农产品加工类制造业影响最大的税种,也是最重要的政策调控工具,在全面减税降费且财政收支矛盾加剧的背景下,探究对农产品加工业的增值税减负,能否在现实层面推动其实现创新驱动型出口质量升级,成为一个亟待解决的研究问题;而更进一步的,如果能,那么又如何优化调整当前的增值税政策,从而用最少的财政成本推进创新驱动型农产品加工业出口质量升级,这是财政约束下政策层面所面临的重要难题,也是我国农产品加工业能够成功实现高质量转型升级的税制保障。本文的主要工作有:一是基于投入产出表、中国工业企业数据库和中国海关数据库等相关数据,分别采用不同的方法及指标,界定或测度了本文所需的主要变量并进行特征性事实分析。二是将增值税税负、创新以及出口质量纳入一个统一的理论框架,对增值税税负影响农产品加工业出口质量的可能情况进行分析,同时还对该影响过程中,作为我们核心关注渠道的创新机制发挥了怎样的作用,并且又是否为最重要的主导机制进行了深入探讨。三是运用微观企业数据检验增值税税负对农产品加工业出口质量的总体影响及各种异质性来源,并且还对增值税税负影响农产品加工业出口质量的结构性差异进行了讨论。四是实证检验增值税税负对农产品加工业创新水平的总体影响,此外还将分别估计增值税税负对不同创新类型的结构影响,并进行了其它更多的异质性探讨。五是采用更为严谨的实证设计和前沿的计量分析工具,对增值税税负影响农产品加工业出口质量的主要机制的贡献率进行实证测量,并基于测量结果判断,在增值税税负对我国农产品加工业出口质量的影响中,创新机制是否为主导机制,在此基础上,还对不同宏微观情景下创新机制贡献率的差异化分布特征进行了深入探究。本文主要研究结论包括:其一,增值税税负会对农产品加工业的出口质量产生负向影响,且这种影响对于不同层面的稳健性检验而言都是可靠的,并且对不同异质性来源的农产品加工业而言,其出口质量受增值税税负调整的影响具有较大的差异。其二,增值税税负对农产品加工业出口质量的影响存在明显的结构性差异,即增值税税负对出口质量的影响,并非平均分布于不同出口质量的农产品加工业之间,而是更多来源于原本就进行高质量出口的农产品加工业。其三,增值税税负与农产品加工业创新活动之间的确存在负向因果关系,且这种关系对于不同稳健性检验而言是可靠的,同时这种关系在不同特征的农产品加工业中的表现情况存在较大差异。其四,增值税税负调整对农产品加工业的创新水平存在结构性影响,其主要是通过产品发明创新、实用新型专利创新这类高质量创新模式来实现。其五,对于我国农产品加工业而言,在增值税税负对其出口质量的影响中,创新机制是所占贡献率最高的主导机制,但该结论只是对整体农产品加工业成立,在不同的宏微观情景下,创新机制的贡献率存在显著的差异化分布特征。基于上述结论,立足中国现实,本文认为应该进一步加大对农产品加工业的增值税减免力度,并着力配套相应增值税优惠措施;另一方面,在当前中国农产品加工业出口质量的整体水平还较低的实际背景下,为了在短期内最大化增值税减税的直接效益,应该以提升农产品加工业出口质量为首要导向,并执行与相关实证研究结论对应的差异化减税策略。最后,在未来实现高质量转型升级是我国发展农产品加工业的核心任务情况下,同时也在财政约束的客观条件下,从长远视角来看,为了长期持续推进创新驱动型农产品加工业出口质量升级,应该以提升创新机制在出口质量变化中所占贡献率为首要导向,并执行与相关实证研究结论对应的结构性增值税调控政策,进而精准地助力于中国农产品加工业实现高质量转型升级,并最终服务于农民增收和农业农村经济的高质量发展。