企业对内部控制管理的重视程度不够的现象广泛存在,内部控制的不足,使企业难以完成运营目标,影响企业的运营效率,对盈利能力产生影响。加强内部控制管理可以增长企业的利润、提高企业的盈利能力。前人的实证研究已经证明,企业的内部控制和盈利能力存在相互关系,是可以相互影响的。因此本文对盈利能力的研究也从内部控制有效性的角度进行分析,试图通过改善内部控制达到提升盈利能力的目的。CG机械研究院是一个大中型国有企业,是经过改制转型为企业的科研院所的典型代表。科研院所是我国在特殊时期计划经济的产物,虽然经过了改制,自主经营,但管理上仍延续了事业单位的机制,资本方面依然靠国家财政拨款为主,盈利水平有待提高。面对复杂多变的市场,这些企业迫切需要一套严谨和适合自身特点的内部控制方法,来提高管理水平,提高经济效益。本文以CG机械研究院为案例,首先从盈利能力的评价指标入手对案例公司的盈利能力进行分析。通过因素分析法及杜邦财务分析法找出影响盈利能力降低的具体指标是总资产周转率和权益乘数,分析这些指标降低的原因,然后结合案例公司的内部控制实况进行具体分析,检查致使盈利能力降低的原因中哪些是内部控制的不足造成的。最后得出,企业在内部控制方面对资产的投入和管理不善、对资本的利用效率低及成本控制不足等现象是对案例公司的盈利能力产生负面影响的主要原因。从而有针对性地在内部控制方面给出适当的建议,及时纠正和改善,以期通过改进案例公司的内部控制现状达到提高案例公司盈利能力的目的。本文从内部控制角度出发研究如何提高企业盈利能力的方法及最后得出的结论对我国同类型经转制的其他科研院所都能够提供一个参考,起到借鉴的作用。