本研究对103种药用植物材料进行了抗菌蛋白的初步筛选工作，确定其中有17种材料可能有抗菌蛋白。对茳芒决明进行了抗菌蛋白的分离纯化：经粉碎、磷酸缓冲液浸提、硫酸铵沉淀、CM-Sepharose FF XK 26阳离子交换层析、两次Mono S阳离子交换层析、Superose 12HR分子筛层析可得到具抗真菌活性的蛋白。纯化的抗菌蛋白在SDS-PAGE上显示单一条带，亚基相对分子质量为28.4kD。 利用毛细管电泳来分析了六种豆科决明属药用植物种子中的水溶性次生代谢物。电泳分离缓冲液为0.1mol／LSDS，0.1mol／L硼酸盐（pH8.5），运行电压为25kV。确定4个峰为六种决明属植物种子的共有峰，并得到各自的特征峰。六种决明属植物种子的毛细管电泳指纹图谱有明显的差异，可利用这些差异对其进行鉴别，并为以后这些种子中次生代谢物的定性定量工作打下基础。 利用毛细管电泳来分析了八个不同产地的当归中的水溶性次生代谢物。以岷县当归为道地药材，确定岷县当归有19个共有指纹峰；八个不同产地的当归有9个共有指纹峰。通过相似度的计算可知，四川南坪和宝兴，甘肃渭源和云南丽江的当归质量和岷县当归较近，青海渭中、湖北利川和建始的当归质量和岷县当归相差较远。