近年来,为切实解决我国居民“看病难”、“看病贵”的问题,我国医疗卫生体制改革不断深入。从2016年4月国务院办公厅正式提出在医疗体制改革试点省份推行“两票制”,到2017年1月初发布“两票制”实施意见的通知,再到2018年在全国范围内全面推开。“两票制”有利于压缩药品流通的环节,打击“走票”等非法行为,规范流通的秩序,在一定程度上降低了药品的价格,提高了药品流通行业的集中度,重塑了医药流通供应链,给药品生产企业、药品流通企业以及公立医疗机构都带来了深刻的影响。本文选取了医药流通行业中民营企业龙头九州通为案例对象,对于医药流通企业而言,营运资金的管理非常重要,营运资金决定了企业是否能够生存下去,因此选择对其营运资金管理进行分析。本文结合营运资金管理理论、供应链管理理论、利益相关者理论,综合运用了文献研究法、对比研究法和案例研究法,对“两票制”背景下,九州通的营运资金管理效果进行研究。首先分析了推行“两票制”后,九州通面临的机遇和挑战,其次分析在“两票制”背景下,以供应链管理理论为指导,对其营运资金管理进行分析,最后对营运资金管理的效果进行研究,研究得出在“两票制”背景下,九州通的营运资金管理效果不尽如人意,比如说存在应收应付款项所占比重较高,供应链上游和下游侵占对方资金的问题等,一旦有一方资金链断裂,对药品流通所涉及到的企业都将产生不利的影响,对此,提出一些有针对性的建议,也为行业内其他的医药流通企业优化营运资金管理借鉴参考。