目的：检测并对比维吾尔族甲状腺癌、维吾尔族甲状腺良性结节,维吾尔族甲状腺癌与汉族甲状腺癌血清蛋白质指纹图谱,筛选维、汉不同种族特异的甲状腺癌蛋白质标记物。方法：运用二维聚丙烯酰胺凝胶电泳(2D-PAGE)技术,构建维族、汉族甲状腺癌与维族甲状腺良性结节的蛋白表达谱,通过图像分析软件交叉比较两组样本,并运用液相色谱-质谱/质谱联用技术(LC-MS/MS)对差异蛋白进行鉴定并在Swiss-prot数据库中搜索蛋白名称、细胞定位及功能分类。结果：维吾尔族甲状腺癌与良性甲状腺结节患者血清对比有11种蛋白质差异表达,其中补体C3、C4b、胰岛素生长因子结合蛋白酸不稳定亚基、血红素结合蛋白在维族甲状腺癌患者血清中上调表达,α 2-巨球蛋白等7种蛋白质下调表达。维吾尔族、汉族甲状腺癌患者血清对比有7种蛋白质差异表达,其中转铁蛋白在维吾尔族甲状腺癌患者血清中上调表达,细胞角蛋白-1等6种蛋白质下调表达。结论：血红素结合蛋白、α 2-巨球蛋白、转铁蛋白等多种标记蛋白联合筛检可为维、汉族甲状腺癌的诊断提供依据。