随着我国对创新型经济建设要求的不断深化,突显出提升国家自主创新能力的重要性。高技术产业拥有较高的R＆D投入强度,是我国自主创新能力建设的重要主体。然而,由于创新活动高风险的特征,以及高技术产业企业与外部投资者之间存在的信息不对称问题,造成创新企业外部融资路径不通畅,限制了研发投入,进一步阻碍创新水平的提升。当前,我国高技术产业的研发投入规模和发明专利申请量在国际上处于领先水平,但研发投入强度和将专利转化为新产品的能力与发达国家还有很大的差距。金融体系具备的风险分散和资源配置等功能深刻地影响着企业创新行为,研究如何提升与完善金融体系对高技术产业的支持作用,有助于促进产业研发投入以及向更高层次自主创新跨越,对我国创新型经济建设有重要意义。基于上述背景,本文对我国高技术产业自主创新的金融支持作用展开研究。首先,本文从创新产出角度衡量高技术产业创新水平,分信贷市场和股票市场研究金融支持产业自主创新的作用机制,为研究建立理论基础。其次,利用统计数据分析发现现阶段我国高技术产业的创新发展存在金融支持总量不足和支持模式单一的问题。在此基础上,本文选用六大高技术产业,利用2009-2019年全国31个省市自治区的面板数据,分创新研发阶段和创新商业化阶段对金融支持自主创新的机制进行了实证检验。本文的研究结论如下:（1）我国金融市场对高技术产业的支持主要在研发阶段,对商业化阶段的支持不足。具体来说,在创新研发阶段,信贷市场规模和效率发展都通过提升研发投入水平从而促进了创新产出的增加;在创新商业化阶段,信贷市场和股票市场对产业创新的作用都不显著;（2）我国金融对高技术产业的支持以信贷市场为主,股票市场没有发挥出明显的作用。具体来说,在研发阶段,信贷市场规模扩大和效率提升可以通过显著促进研发投入,从而促进创新产出的增加;股票市场在研发阶段和商业化阶段都没有对产业创新产生显著的影响。最后,在研究结论的基础上,本文结合我国信贷市场和股票市场对创新发展的实践,提出了完善我国金融对高技术产业支持的政策建议。