随着我国资本市场不断发展与完善,自然人股权投资与转让案例日益增多。目前我国自然人股权转让个人所得税最新征管政策为国家税务总局2014年第67号公告,该公告对股权转让行为、征纳关系、转让收入的确认等方面均做出明确规定。但由于自然人股权转让行为隐蔽、工商税务部门间协同能力较弱、税收前置功能形同虚设、股权转让价款难以核定等因素,导致该公告仍存在诸多征管盲点与缺陷,造成税款流失、税源监控管理弱化等问题。本文在详细梳理国内外关于自然人股权转让研究文献的基础上,通过案例分析的模式研究并判断目前我国自然人股权转让个人所得税政策存在三方面的征管盲点与缺陷。第一,股权转让计税依据难以准确核定。第二,纳税人与扣缴义务人空间地域不一致造成征管效率低下。第三,股权转让优惠款与对赌协议款处理不当导致税收争议。本文通过借鉴世界各国在此三方面的征管经验,以股权价值理论、控制权溢价理论以及税收风险管理理论为基础,提出三方面政策完善建议。第一,本文提出相对价值模型、直接价值模型两类计税依据核定模型。相对价值模型由可比企业通过卸载可比股权价值因素、加载目标股权价值因素的方式间接核定计税依据;直接价值模型由被转让股权账面成本,通过考虑净资产溢价、流通溢价与控制权溢价等因素直接核定计税依据。然后通过案例检验的方式验证上述价值模型的适用性。第二,优化代扣代缴征管制度,通过变更扣缴义务人解决纳税主体空间错配征管难点。第三,通过对转让优惠款和对赌协议款的损失限额扣除、折现纳税等特殊化处理,降低税收争议。本文的创新点在于提出计税依据核定模型的新思路,基于上述三项政策建议,能够有效监控税源、防止税款流失、增强征收能力、提升征管效率,同时合理维护纳税人权利。