黄瓜花相关性状的QTL分析

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黄瓜(Cucumis sativus L.)是重要的果菜类蔬菜,在黄瓜育种中,第一雌花节位(First female flower node,FFFN)低,雌花率(Female flower ratio,SEX)高,早花(Early Flowering,EF)均能有效地提高黄瓜的早熟性和高产性,因此是重要的育种目标。大量研究均认为这三个性状都是多基因控制的数量性状,本研究利用以全雌黄瓜品系S1000和强雄黄瓜品系S1002为亲本的含153个株系的F2群体构建的高密度遗传连锁图谱进行QTL定位。将控制第一雌花节位、雌花率以及早花的QTL定位在黄瓜分子标记连锁图上,以期为黄瓜早熟、高产育种提供可用的连锁标记,促进相关基因的分离与克隆。在黄瓜高密度遗传图谱的基础上,通过调查S1000×S1002组合的F2:3群体2015年春季第一雌花节位和雌花率性状,对这两个性状进行QTL定位,并进一步对主效QTL所在区段进行候选基因分析。结果显示,第一雌花节位检测出一个QTL,FFFN6.1,位于第6染色体,其贡献率(R2)为9.39%;雌花率检测出两个QTL,位于第3和第6染色体,分别为SEX3.1(R2为6.55%)和SEX6.1(R2为14.03%)。推测FFFN6.1的候选基因为Csa6G216950,SEX6.1的候选基因很可能是F基因。通过调查S1000×S1002组合的F2:3群体三季中的早花性状,对该性状进行了QTL定位,并进行候选基因分析。三季共检测出6个QTLs,分别分布在第3、5、6、7号染色体上,分别为EF3.1-1(R2为11.4%),EF3.1-2(R2为10.1%),EF5.1(R2为9.1%),EF6.1(R2为9.2%),EF6.2(R2为13.8%),EF7.1(R2为13.2%),共解释66.8%的表型变异率,在两季中重复检测出的QTL位点有1个,其中EF3.1所在区间,共有140个基因;EF6.2所在区间,共有839个基因;EF5.1所在区间,共有86个基因,这三个区域预测到的基因数目太多,目前还不能确定哪些基因与早花性状相关,尚需进一步的精细定位及分离鉴定。EF6.1所在区间共有6个基因,EF7.1所在区间共有23个基因,初步确定Csa6G382930,Csa7G430750和Csa7G431330分别为EF6.1与EF7.1的候选基因。
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