茶叶中β-葡萄糖苷酶基因cDNA克隆与序列分析

来源 :安徽农业大学 | 被引量 : 10次 | 上传用户:looksky1989
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该论文首次从茶叶中克隆出β-葡萄糖苷酶基因cDNA序列,结果如下:依据茶树叶片生化特点,应用Chomcznski一步法,并作了部分修改,从鲜叶中分离、提取总RNA.利用GenBank中已经登录的其它植物中该酶基因的保守序列,设计一对简并引物,采用RT-PCR技术,从茶树扩增出208bp的cDNA片段.将扩增片段克隆到PMD18-T上进行序列测定和分析,结果表明,此片段核苷酸序列与其他植物β-葡萄糖苷酶基因cDNA相应序列有很好的同源性,推断该PCR特异产物为茶树β-葡萄糖苷酶基因cDNA片段.以此特异片段设计特异引物,采用RACE技术分别获得β-葡萄糖苷酶cDNA3端581bp和5端895bp片段,后再依据上述两段序列设计一对引物,扩增出酶的全长序列1475bp.经Blast搜索表明:克隆所得碱基序列和推导的氨基酸序列与已克隆出的小松树、西葫芦拟南芥等植物体内β-葡萄糖苷酶基因的cDNA相应序列有40﹪—60﹪的同源性,因此我们推断扩增所得到的序列为茶树中β-葡萄糖苷酶基因的cDNA.利用分子生物学软件对氨基酸序列和二级结构进行分析和比较.结果表明,该序列的3-端和5端的非编码序列长度分别为189bp和233bp,开放阅读框为1050bp,编码350氨基酸,其转运肽长度为82个氨基酸,成熟蛋白由257个氨基酸组成.经Garnier法预测,茶树β-葡萄糖苷酶蛋白二级结构与其他植物相似,螺旋构象14.33﹪、伸展构象33.81﹪、折叠构象25.43﹪.前体蛋白的分子量为40kDa,等电点(PI)为5.2,为水溶性蛋白.
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