传统的工作流模型往往只注重活动以及活动之间的关系，而忽略了活动的主体角色和角色之间的交互关系。而对于流程重组主要集中在理论和优化算法研究方面，缺乏理论与实践相结合的实际应用。本文提出基于角色、Petri网的工作流建模模型和业务流程重组框架，并将该建模模型和实施框架应用到毕业设计（论文）管理系统，具有一定的理论意义和实际应用价值。　　本文仔细分析传统工作流模型的不足，建立一种新的工作流建模模型，不仅可以很好的描述活动及其之间的关系，还可以很好的描述活动的执行角色以及角色之间的交互，该模型增强了工作流模型的全面性和柔性，从而使其更好的支持业务流程重组。接着，在原BPR实施框架的基础上提出了一种基于Petri网和角色的业务流程重组实施框架，该实施框架，借助Petri网和Petri网的建模工具对系统进行建模，使用Petri网理论及关联矩阵算法对已有模型进行优化，包括角色动态分配以及过程结构优化，最终形成新的流程。该框架更加具体的阐述了系统建模、系统分析及系统优化的过程。　　最终，本文对以上提出的建模方法和BPR实施框架对本科毕业设计（论文）管理系统进行了建模与优化，并使用ZSH框架、tomcat应用服务器以及oracle数据库对本科毕业设计（论文）管理系统进行了设计与开发。应用证明，该系统极大提高了模块的重用性和独立性，加强了对业务流程的控制，验证了该方法的有效性和可行性。