北方5省区致病疫酶生理小种监测及遗传多样性分析

来源 :河北大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ccqccqccq
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
伴随着我国马铃薯主粮化的全面推进,将给作为马铃薯主产区的北方地区带来更多的机遇与挑战。但由致病疫霉(Phytophthorainfestans(Mont.)deBary)引起的马铃薯晚疫病是该区域马铃薯生产中的重点防控对象。而该致病菌的群体表型、遗传结构多样性与病害的发生和流行程度密切相关。因此本试验旨在通过以上两方面的研究为当地马铃薯晚疫病的防控和科学育种提供一定参考。
  本试验的主要研究内容为:(1)采集、分离并纯化2017年北方五省区(河北、吉林、辽宁、黑龙江和内蒙古)的马铃薯致病疫霉,明确其生理小种组成和毒力情况,尤其是超级生理小种的分布与动态变化;(2)通过改变鉴别寄主培养基部分成分的含量及选择不同转接时期对组培苗的培养条件进行初步优化,使含有R1至R11单基因抗性的一整套马铃薯组培苗鉴别寄主能整齐一致的生长,及时准确地用于致病疫霉生理小种的鉴定;(3)利用SSR分子标记技术对2016年及2017年采自5省区197株致病疫霉的基因型进行鉴定和命名,并对其进行遗传多样性分析,明确北方5省区马致病疫霉在DNA分子水平上的遗传差异;(4)采用PCR-RFLP方法分析2016年和2017年5省区197株致病疫霉菌株的线粒体DNA(mtDNA)单倍型类型,并比较其不同温度下不同线粒体单倍型菌株的菌丝生长量、产孢量以及对马铃薯离体叶片的致病力,明确北方5省区马铃薯致病疫霉线粒体DNA单倍型组成和分布以及不同线粒体单倍型与其生物学特性之间的关系。
  本试验获得的研究成果如下:
  1、2017年北方5省区采集病叶数137株,分离纯化出的菌株数82株,鉴定小种的菌株总数82株。监测到致病疫霉生理小种的类型数为35种,其中优势生理小种为超级生理小种R1.2.3.4.5.6.7.8.9.10.11,出现的频率为35.37%,且优势生理小种在5省区均有分布。
  2、明确了2017年北方5省区采集的菌株中存在已知11个主效抗性基因对应的毒力基因,即Vir1-Vir11。抗性基因R7、R9、R10、和R11能被80%-88%的分离测试菌株所克服;而R1则被90%以上的分离株所克服。
  3、改良后的鉴别寄主培养基为:当MS培养基中琼脂的量从7g/L增至10g/L时,可显著促进组培苗扎根及生长,同时降低了杂菌对11个鉴别寄主组培苗的污染,染菌率由30.56%下降至13.89%;将培养基中蔗糖的量从30g/L降为26g/L时适宜于其中7个寄主组培苗的生长,而生长较慢的R1和R11最适的蔗糖含量分别为28g/L和27g/L,生长较快的R3和R5最适的蔗糖含量分别为24g/L和23g/L。
  4、对2016年和2017年共197株致病疫霉进行SSR基因型测定,在SSR位点Pi4B和Pi4G上共检测到10个等位基因。鉴定出的14个SSR基因分别为A-03、A-10、B-01、D-03、E-01、F-01、F-02、F-06、G-02、G-03、G-07、K-01、L-01、N-01,其中A-10和N-01为这些地区之前未见报道的新基因型;F-06为主导基因型,占24.3%。
  5、SSR扩增结果的聚类分析表明:5省区的菌株的聚类与地理来源并无相关性。通过Popgene1.32软件对5省区的群体遗传多样性进行分析,显示它们之间的遗传差异较小,但2017年与2016年相比,致病疫霉群体的遗传多样性在增加。
  6、物种表型由基因型所控制,因此对致病疫霉SSR基因型与生理小种之间的关系进行研究,但两者之间并无一一对应关系。
  7、对2016-2017年两年间北方5省区内的不同地区致病疫霉线粒体单倍型的组成进行测定,共检测出三种类型,即Ⅱa、Ⅱb和Ⅰa。且两年间明显优势的mtDNA单倍型都为Ⅱa,平均出现频率为64.2%。两年间均未检测到Ⅰb型线粒体单倍型菌株。
  8、比较了不同线粒体单倍型菌株的菌丝生长量、产孢量以及对马铃薯离体叶片的致病力,4种线粒体单倍型菌株均在20℃时生长最快,其中Ⅱa型菌株的生长速度最快(6.43mm/d)、平均产孢量也最多(33.5×104个/mL),Ib型菌株生长速度最慢(3.41mm/d),产孢量也最少(6.4×104个/mL);不同线粒体单倍型菌株均可以使马铃薯离体叶片产生病斑,但致病能力有一定差异,从强到弱顺序依次为Ⅱa、Ⅱb、Ⅰa、Ⅰb。
其他文献
司法是正义的最后一道防线,随着近几年冤假错案逐渐漏出水面,其在刑事侦查阶段中侦查行为的违法性、不规范性,也不断引起学术界与实务界的关注。骗供、诱供作为新样态的取证行为在侦查策略与非法侦查行为中处境尴尬。然而,何为骗供、诱供,无论是刑事诉讼法以及相关司法解释,还是教学课本上都没有明晰的规定,这就极易导致骗供、诱供这类非法侦查行为以及获得的被告人供述成为非法证据排除的漏网之鱼,本文拟以文献研究方法和比
学位
新疆维吾尔自治区是一个多民族的地区,那里有丰富多彩的文化。婚俗作为人类重要的习俗之一,能够反映出一种特定的文化。这篇论文通过婚俗的角度,比较维吾尔族和汉族文化的异同。  新疆维吾尔自治区坐落于中国的西北部,这是一个充满异域文化的地方。这个地区的总人口有2000多万,47个民族聚居在一起。维吾尔族是新疆人口最多的少数民族,这个民族影响着整个新疆的稳定。虽然这些民族都有不同的宗教信仰,有10几个民族都
学位
双链DNA病毒感染是临床治疗中的难点之一,目前尚未找到有效抑制此类感染的药物。在抗病毒药物研发过程中,发现病毒特殊组分与宿主成分的差别是研发药物的关键。因此,如果能够找到病毒组装中的关键组分,并以这些组分为靶点找到它们特异性的抑制剂,就能为病毒感染的诊断和治疗提供巨大帮助。双链DNA病毒中的噬菌体phi29包装机制存在特殊性,在包装过程中涉及了多种物质,因此成为研究双链DNA病毒核酸包装的生物模型
研究背景:普通的先天性白内障为出生后即发现白内障,欲跟踪白内障发生、发展的过程,就需在胚胎期进行解剖,研究过程较为困难且与发病量更大的老年性白内障发生发展过程难以对应。而晚发性白内障,使得科学研究人员得以在小鼠开眼后,逐步有针对性的实施分子机制的分析,也有利于新药开发时,观察药物抑制突变基因或者控制性状进展的过程,因此,晚发性白内障突变小鼠模型对于人类的老年性白内障研究是极为方便的。  2015年
经皮给药系统(Transdermal drug delivery system, TDDS)是药物通过皮肤吸收进入血液循环达到治疗或预防疾病的一种药物控释系统,具有避免肝脏首过效应和胃肠道对药物的破坏、延长药物作用时间、减少毒副作用和提高病人耐受性等优点[1]。透皮效率和载药量是TDDS研发面临的关键问题。本课题组之前的研究证明,负载醇质体(Ethosomes, Eth)的电纺丝素(Silk fi
学位
RNA编辑是改变RNA分子序列的一种转录后修饰现象,包括碱基的插入、缺失或核苷酸的替换。目前发现从病毒到高等真核生物都广泛存在RNA编辑现象。PPR(pentatricopeptide repeats)蛋白是植物中具有RNA编辑功能的一类重要的蛋白质,大多数关于PPR蛋白的功能机制研究结果来源于反向遗传学的实验结论。因此,对于PPR蛋白结构与功能关系的研究是破解植物RNA编辑机制的关键。  OTP
可得然胶是一种水不溶性β-D-1,3-葡聚糖,具有加热成胶特性,在食品、生物医药等领域具有广阔的应用前景。可得然胶是土壤杆菌(Agrobacterium sp.)等细菌在氮源缺乏的条件下产生的一种细菌胞外多糖。对于可得然胶的合成机制已有了一定的认识,研究发现,可得然胶由底物UDP-葡萄糖经可得然胶合酶催化合成,编码可得然胶合酶的基因是crdASC,同时受转录因子crdR的正向调控。但是,对于土壤杆
学位
脂毒是产生肥胖相关疾病的重要原因,脂毒的产生常常伴随着脂代谢失衡。三酰甘油是脂肪酸代谢途径中的重要一环,具有显著的脂毒缓解作用。脂毒的发生机制比较复杂,目前人们对其认识仍不完全清楚。为了更深入了解脂毒机制,我们在油酸敏感菌株pah1△背景下,利用酵母的全基因组必需基因超表达文库,筛选并得到油酸耐受基因,我们发现油酸耐受基因多数都与蛋白质折叠相关,于是我们推测油酸引起的脂毒胁迫可能会损害蛋白质正确折
引起马铃薯晚疫病发生的病原菌是致病疫霉(Phytophthorainfestans(Mont.)deBary),属于藻界、卵菌门、卵菌纲、腐霉科、疫霉属(Phytophthora)。在马铃薯原产地及其它主产区,其最初观察到的主要是A1交配型,但随着马铃薯种质资源的迁移以及病菌自身的分化变异或其它因素,在许多马铃薯产区逐渐出现了A2交配型,且自育型和A1A2型也开始增加,表明致病疫霉产生卵孢子的潜在
自 1945 年第一篇人类自身抗原论文发表以来,有关人类自身抗原(autoantigen)的论文已发表超过12万篇。目前我们在1000多篇论文中发现了一些已被证明是健康人和不同疾病患者的重要调节剂或生物标志物。这些有关人类自身抗原的报告出现在分散的数千篇论文和文献中,因此建立一个能囊括所有已发表的自身抗原的数据库是有必要的。本研究使用文本挖掘结合手动筛选的方法构建了AAgAtlas数据库1.0。使