灰葡萄孢除草相关基因的克隆与功能分析

来源 :河北农业大学 | 被引量 : 3次 | 上传用户:yeka
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本实验室利用mRNA差异显示技术对灰葡萄孢野生菌株BC4和部分诱变菌株(强除草活性菌株和弱除草活性菌株)进行分析,得到一个694 bp的基因片段,该基因可能调控灰葡萄孢除草活性,本研究利用Genomic Walking技术对该基因片段进行扩增,通过两次5’端Genomic Walking和两次3’端Genomic Walking,将该基因片段694 bp扩增到3961 bp,在NCBI网站进行BLAST比对表明,该基因与富克葡萄孢盘菌(Botryotinia fuckeliana,灰葡萄孢的有性态)中的calcium/calmodulin dependent proteinkinase(CaMK)同源性98%。根据GenBank报道Botryotinia fuckeliana的完整CDS,从两端设计引物,利用RT-PCR技术克隆了BC4的cDNA全长。Southern杂交结果表明该基因在基因组中以单拷贝形式存在。对CaMK基因进行生物信息学分析,利用DNAMAN软件将CaMK基因cDNA序列与DNA序列进行比对,发现BC4菌株的CaMK基因含有7个外显子和6个内含子。利用DNAStar软件对CaMK蛋白性质进行预测表明,CaMK预测蛋白的分子量为81.8748 kD,共有730个氨基酸,包括95个强碱性氨基酸(K,R),116个强酸性氨基酸(D,E),216个疏水氨基酸(AILFWV),160个极性氨基酸(NCQSTY),等电点(Isoelectrie Point)为6.22。利用ScanPro site软件分析CaMK一级结构中包含的保守结构域结构特征,发现CaMK基因一级结构中包含蛋白激酶ATP结合位点和丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性位点。利用SOPMA软件分析CaMK蛋白的二级结构,用SWISS-MODEL软件构建CaMK蛋白的三维结构模型。用已获得的灰葡萄孢CaMK基因5’端开放阅读框前1330 bp基因组DNA序列在softberry网站中进行启动子可能功能分析。构建了重组CaMK质粒,并成功地在E.coli BL21中得到表达。结果显示重组的CaMK蛋白大量表达在沉淀中,在上清中没有表达。研究的结果为蛋白纯化和蛋白抗体制备以及进一步研究该基因的功能奠定了基础。用CaMK特异性抑制剂KN-62处理灰葡萄孢孢子,结果表明,60μM的KN-62对灰葡萄孢孢子萌发抑制率为50%,80μM的KN-62对孢子萌发抑制率可达98%以上;灰葡萄孢用80μM的KN-62处理后对番茄致病性明显降低,用80μM KN-62处理后所产毒素的除草活性明显下降。表明CaMK基因在灰葡萄孢孢子萌发、致病性以及除草活性物质产生中起重要调控作用。
其他文献
唐皇城含光门门道遗址位于西安城墙的南面西侧,始建于隋文帝开皇二年(582年),延续至今已有1400年。它是唐代长安皇城南面的三门之一,有着悠久的历史,也是迄今为止发现的最为
海上风力发电正逐渐成为新能源领域发展的重点,我国拥有漫长的海岸线,近海风能资源丰富。但相对于西方国家,我国海上风电场技术还只是处于起步阶段,设计、施工经验相对匮乏。
目前对于高层建筑的结构分析和设计方面的研究较多,而施工过程对结构构件内力和变形的影响,则研究的相对较少。通常对于建筑结构的分析是建立在整个模型建好之后,然后再施加
地下工程中围岩力学参数的测试是确定支护参数、围岩分级、分析围岩稳定性的基础,其中主要的岩石力学参数包括粘聚力和内摩擦角(以下简称c、ψ参数)以及单轴抗压强度UCS。室内岩
苔草属是莎草科中最大的属,全球约2000种以上,广泛分布于世界各地,多数分布在北温带的北美洲和东亚。我国约500多种,是我国植物区系组成的主要大属之一,广布全国各地。由于苔草属
冻结法凿井是我国煤矿穿过深厚冲积层的有效工法之一。在我国的安徽、山东和河南等矿区,深厚冲积层的底部含水层直接覆盖在煤系地层之上,随着矿井采掘生产,底部含水层出现疏水固