乳腺癌肿瘤干细胞组蛋白甲基化的图谱特征

来源 :中国科学院北京基因组研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ww20080808
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乳腺癌是在女性中发病率最高的恶性肿瘤,严重威胁着女性的健康。乳腺癌常常会发生转移以及预后复发,其关键原因之一是乳腺癌肿瘤干细胞的存在。肿瘤干细胞是肿瘤中小部分具有自我更新能力,能够产生异质性肿瘤细胞的细胞,而癌症的发生发展与组蛋白修饰的异常有着密切的关系。本课题以乳腺癌肿瘤干细胞为研究材料,对乳腺癌肿瘤干细胞H3K4me2和H3K27me3组蛋白甲基化修饰的图谱特征进行初步分析。本课题旨在利用生物信息学方法初步研究乳腺癌肿瘤干细胞(CSC)和乳腺癌非肿瘤干细胞(NCSC)中组蛋白甲基化图谱的差异情况,挖掘乳腺癌肿瘤干细胞特异性产生和维持的表观修饰机制。主要内容包括利用流式细胞分选技术分选乳腺癌肿瘤干细胞,并进行相应组蛋白甲基化修饰H3K4me2和H3K27me3特异性ChlP-seq以及后续生物信息学数据分析。分析结果表明,CSC与NCSC之间组蛋白甲基化图谱存在着明显的差异;且H3K27me3图谱在CSC中更具有特异性,提示H3K27me3对CSC的特异性维持可能更具调控作用;此外两种组蛋白修饰差异富集峰主要富集在MAPK、Wnt和GnRH等参与细胞增殖、转移与干细胞自我更新的通路中,提示组蛋白甲基化修饰可能通过调控肿瘤干细胞相关通路中基因的表达对肿瘤干细胞的特异性进行调控;通过分析发现,两种组蛋白修饰图谱间差异显著,提示两种组蛋白甲基化修饰可能对CSC的干性特征维持具有不同的调控形式。
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